譯者的話
前言
參編者
推薦的背景讀物
第1章 蛋白質(zhì)純化和定性的策略
1.1 單元 蛋白質(zhì)純化和定性概述
目標(biāo)和研究對(duì)象
蛋白質(zhì)純化的原料
蛋白質(zhì)的檢測(cè)和分析
蛋白質(zhì)分離和純化方法
蛋白質(zhì)產(chǎn)物的定性
蛋白質(zhì)純化實(shí)驗(yàn)室
1.2 單元 蛋白質(zhì)純化流程圖
可溶性重組蛋白
不可溶性重組蛋白
可溶性非重組蛋白
膜相關(guān)的和不可溶性重組蛋白
第2章 計(jì)算分析
2.1 單元 用于蛋白質(zhì)序列分析的疏水分布圖
方法學(xué)
應(yīng)用
結(jié)論
2.2 單元 蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)的方法
二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)方法的應(yīng)用
2.3 單元 使用BLAST程序家族進(jìn)行序列相似性搜索
進(jìn)入BLAST程序和文檔
BLAST介紹
BLAST程序
2.4 單元 因特網(wǎng)上的蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)
蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)
蛋白質(zhì)家族數(shù)據(jù)庫(kù)
2.5 單元 蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
同源性建模
序列分布圖法
線程法
從頭結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
2.6 單元 蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)建模
詞匯
進(jìn)入SwissModel程序和文檔
ExPDB數(shù)據(jù)庫(kù)
創(chuàng)建首次法建模查詢的格式
觀看SwissModel結(jié)果
2.7 單元 比較蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
比較建模的步驟
第3章 檢測(cè)和分析方法
3.1 單元 分光光度法確定蛋白質(zhì)濃度
基本方案1 計(jì)算一個(gè)蛋白質(zhì)的摩爾吸收系數(shù)
基本方案2 折疊蛋白質(zhì)摩爾吸收系數(shù)的測(cè)定
基本方案3 使用摩爾吸收系數(shù)通過(guò)吸收光譜測(cè)定蛋白質(zhì)的濃度
基本方案4 通過(guò)205nm處的吸收光譜測(cè)定蛋白質(zhì)的濃度
基本方案5 粗蛋白質(zhì)提取液總蛋白質(zhì)濃度的測(cè)定
3.2 單元 定量氨基酸分析
樣品制備
平均組成的計(jì)算
3.3 單元 肽和蛋白質(zhì)的體外放射標(biāo)記
基本方案1 使用碘珠對(duì)酪氨酸或組氨酸殘基進(jìn)行碘化
備擇方案1 用氯胺T或Iodogen在酪氨酸或組氨酸殘基碘化
備擇方案2 使用乳酸過(guò)氧化物酶在酪氨酸或組氨酸殘基碘化
輔助方案1 等摩爾碘化以獲得產(chǎn)物的高收率
輔助方案2 用HPLC從碘化產(chǎn)物中分離未標(biāo)記的肽
基本方案2 用Bolton-Hunter試劑在賴氨酸殘基或N端碘化
基本方案3 通過(guò)酸酐乙酰化在賴氨酸殘基或N端進(jìn)行14C或3H標(biāo)記
備擇方案3 通過(guò)還原性烷基化在賴氨酸殘基或N端進(jìn)行14C或3H標(biāo)記
備擇方案4 用碘乙酸或碘乙酰胺在賴氨酸殘基進(jìn)行14C或3H標(biāo)記
基本方案4 在肽合成過(guò)程中引入標(biāo)記的氨基酸殘基
備擇方案5 在肽合成過(guò)程中在N端進(jìn)行選擇性標(biāo)記
3.4 單元 總蛋白質(zhì)的分析
基本方案1 總蛋白質(zhì)定量的雙縮脲分析
基本方案2 總蛋白質(zhì)定量的Hartree-Lowry分析
基本方案3 總蛋白質(zhì)定量的二喹啉甲酸(BCA)分析
基本方案4 總蛋白質(zhì)定量的酸消化——茚三酮法
輔助方案1 熱封玻璃管
基本方案5 測(cè)量總蛋白質(zhì)的考馬斯染料結(jié)合分析(Bradford分析)
輔助方案2 蛋白質(zhì)樣品的凝膠透析
……
第4章 提取、穩(wěn)定和濃縮
第5章 重組蛋白的生產(chǎn)
第6章 重組蛋白的純化
第7章 重組蛋白的定性
第8章 常規(guī)層析分離
第9章 親和層析
第10章 電泳
第11章 化學(xué)分析
第12章 翻譯后修飾：糖基化
第13章 翻譯后修飾：磷酸化和磷酸酶
第14章 翻譯后修飾：特定的應(yīng)用
第15章 蛋白質(zhì)的化學(xué)修飾
第16章 質(zhì)譜
第17章 肽的制備和處理
第18章 蛋白質(zhì)互相作用的鑒定
第19章 蛋白質(zhì)相互作用的定量
第20章 肽酶
第21章 基于凝膠的蛋白質(zhì)組分析
附錄1 試劑和溶液
附錄2 常用的度量制和數(shù)據(jù)
附錄3 常用技術(shù)
附錄4 試劑和設(shè)備供貨商
參考文獻(xiàn)
索引
