"精要速覽系列(Instant Notes Series)"叢書是國外教材"Best Seller"榜的上榜教材。該系列教材結構新穎，視角獨特，重點明確，脈絡分明，圖表簡明清晰，英文自然易懂，被許多高等院校雙語教學選用。《生物信息學(第二版)》在前一版基礎上修訂，涵蓋了生物信息學的基本內容及拓展知識。《生物信息學(第二版)》共分三大部分，包括學科概況(A～B章)、基礎部分(C～I章)、應用領域(J～R章)，合計18章：A生物學研究新面貌、B生物信息學的定義、C物理學要素、D數據與數據庫、E數據類別、F計算、G概率與統計、H模型與數學技術、I人工智能與機器學習、J基因組與其他序列、K轉錄組學、L蛋白質與蛋白質組學、M代謝物組學、N超分子結構、O生化動力學、P生理學、Q圖像分析、R文本分析。書前附有縮略詞表，書后附有進一步閱讀的文獻。《生物信息學(第二版)》適合普通高校生命科學、醫藥科技，以及生物信息學相關專業教學使用，也可供科研人員參考閱讀。
前言
譯者前言
縮略詞
A 生物學研究新面貌
B 生物信息學的定義
C 物理學要素
D 數據與數據庫
E 數據類別
E1 數據類別
E2 生物信息學中呈現數據的做法
F 計算
G 概率與統計
G1 概率和概率分布
G2 條件概率和貝葉斯法則
G3 基本的統計學檢驗
H 模型與數學技術
H1 系統特征
H2 圖論及其應用
H3 常微分方程與代數
H4 高級建模技術
H5 形狀、變形與生長
I 人工智能與機器學習
I1 人工智能與機器學習概論
I2 人工智能與機器學習的統計學方法
I3 人工智能與機器學習的計算方法
J 基因組與其他序列
J1 數據庫與數據源
J2 基因組注釋
J3 序列分析
J4 序列家族、序列比對與系統發育
J5 結構域家族與數據庫
K 轉錄組學
K1 轉錄譜
K2 轉錄分析的統計學問題
K3 分析差異表達基因
K4 多元技術和網絡推理
K5 數據標準和實驗設計
L 蛋白質與蛋白質組學
L1 蛋白質組學技術
L2 互作蛋白質組學
L3 相互作用數據庫和網絡
L4 結構生物信息學
L5 結構分類
L6 結構預測與建模
L7 分子動力學與藥物設計
M 代謝物組學
N 超分子結構
N1 超分子結構
N2 組織與生物體尺度結構
O 生化動力學
O1 代謝網絡研究
O2 微積分和代數學的應用
P 生理學
P1 生理學
P2 整合生物學與植物模擬
P3 整合生物學——總結
Q 圖像分析
Q1 什么是圖像分析?
Q2 圖像分析如何應用到生物科學研究中?
Q3 圖像增強
Q4 特征檢測
Q5 數據析取
R 文本分析
進一步閱讀
索引
A生物學研究新面貌
要點
引言
隨著各種專業與日俱增的分化，生物學的研究也逐漸多樣化，從20 世紀70 年代中期開始，以4 種新的方法與技術為核心的驅動力改變了生物學的研究方式。 本節將依次介紹。
萬物皆分子
從最初的基礎生物化學到最終的幾乎所有生物學門類，分子生物學與遺傳學的結合已成為鑒定生物過程中組成成分的一大利器。
小型化與自動化
生物技術專家已經發展并將繼續尋求從更小的生物樣本中挖掘更多信息的技術。 自動化機器的出現使得高效并可重復性地處理大量樣本成為可能。 這些技術被稱為高通量技術。
圖像分析
為了使高通量技術產生的大容量數據(每個樣本MB 級別)易于處理，原始輸出通常由計算機程序編譯過的圖像呈現。
計算與統計建模
高通量技術產生的大量數據通過一系列的統計分析，確定生物對象(基因、蛋白質等)個體與群體的性質。 生物過程源于這些生物對象之間的相互作用，已經有大量的計算方法用來模擬這些過程。 這些生物過程最簡單的形式包含生化反應或基因調控的相互作用網絡。 然而，生物現象(或生物系統)的動力學和量化行為也可以通過更細致的數學模型來表現。 這些模型可以通過計算機模擬的方式進行"what-if"實驗，在這種情形中，模型的質量關系到它的模擬能力，尤其是在預測系統的行為時。 這些數學模型只有配備高性能計算機時才能得以實現，意味著生物學變得越來越像物理學，因為理論生物學家正趕上并很有可能會超越純粹的實驗生物學家。
研究方式轉變的結果
這些變化的結果是生物學家將花費越來越多的時間在數據分析上，而花費在實驗本身的時間較少。 這些改變也導致了對能夠及時以有生物學意義的方式管理和分析海量數據的人員的需求迅速增長。 這些人就是生物信息學家。 章節B 將通過一些定義描述生物信息學的簡短歷史。
相關章節
生物信息學的定義(B)轉錄組學(K)概率與統計(G)蛋白質與蛋白質組學(L)模型與數學技術(H)圖像分析(Q)
直到20 世紀的25 年，生物學的研究仍是觀察和描述"生物體"的形態，以及它們在不同環境和遺傳背景下的行為和功能。 最初，這些"生物體"是可見的單個植物或動物(生物學)，或者是生物群體及它們相互之間和與周圍環境的作用關系(種群生物學，生態學)。 外科醫生和植物學家開始研究動物和植物體內
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