一、定義不同
SCI正刊就是指正常出版的SCI期刊，就像月刊、半月刊、周刊等，出版的期刊都是連續的有規律的，會標明第幾期期刊。而SCI增刊是在期刊正常出版刊期外因為某些特定原因而額外增加的刊期。比如某本SCI期刊一年下來正常刊期是6期，結果出版了8期，那多余的兩期就是增刊。
二、刊期和備案有差異
每種期刊每年可以出版兩期增刊，且出版增刊前要申請備案，否則會有處罰。而正刊可以按照正常刊期，一期一期的正常出版。比如月刊，一年就出版12期，季刊，一年就出版四期。另外，SCI期刊可以有增刊，但不一定出版增刊。
三、發文要求有不同
SCI增刊發文量大，要求相對較低，即一篇文章能發表增刊不代表能發表正刊。
四、含金量不同
SCI論文有評職稱的作用，認可要求會因職稱單位不同而異，一般來說SCI增刊評職稱是無用的，即發表SCI評職稱要選正刊。而想選增刊的，要確認在本單位SCI增刊認可嗎。當然若只是分享科研成果，就無所謂了，發不了正刊的，可以選擇增刊。
五、檢索有不同
SCI增刊一旦被檢索了，也會顯示增刊字樣。
關于SCI增刊與正刊，還有其他方面的區別，這里不再做具體介紹，有需要的朋友，可以進一步了解。不過，國內評職稱發SCI，選正刊更為合適。
六、正刊和專刊發表的區別
一個期刊正常出版的論文都是有卷有期有頁碼。正刊（regular issue）：如一個期刊每年一卷幾期，發表的幾期論文都沒有一個特定的主題，互相之間沒有影響，就稱之為正刊。
專刊（special issue）：分為兩種情況，一種是占正刊版面的專刊，另一種是實實在在的專刊。
（1）專刊占正刊版面：占正刊中的某一期，該期有卷有期有頁碼，所發表的論文都是在某一主題下。如一個期刊一年共6期，第2期有一個主題，該期的論文都與該主題相關。
（2） 專刊版面發表版面是專刊版面。除了正刊出版外，有些期刊會新增一期，該期有正常的卷但是無期，所發表的論文都是在某一主題下。如一個期刊一年共6期，新增了2期專刊版面，這2期專刊版面不占據6期中的任何一期。
正規的專刊（special issue）仍然是正刊，面向某個熱點研究方向，只是區別于一般包含多個研究方向文章的普通正刊（regular issue），而不是增刊(supplementary issue)，見刊檢索會有special issue字樣，有些單位會將special issue等同于中文期刊的特刊和專刊，所以可能會有區別。
SCI期刊的增刊概念和國內期刊的增刊是一樣的，一般是刊物針對某一專題專門設置的欄目，或者就是一期獨立的刊物，作為增刊之所以備受爭議是因為增刊普遍不被檢索收錄，有些獨立出版的增刊刊物整體水平與正刊無法相提并論，加上不被檢索，所以增刊的認可度向來很低，但是SCI的增刊很多是被檢索收錄的，發表SCI增刊與發表正刊最終結果可能沒有什么區別，文章都會被SCI檢索收錄。
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