引論:我們?yōu)槟砹?3篇生物信息學(xué)培訓(xùn)范文,供您借鑒以豐富您的創(chuàng)作。它們是您寫作時(shí)的寶貴資源,期望它們能夠激發(fā)您的創(chuàng)作靈感,讓您的文章更具深度。
篇1
二、當(dāng)好大學(xué)生村干部必須轉(zhuǎn)變角色,明確職責(zé)。
村官要準(zhǔn)確定位,做好村情民意的調(diào)查員,當(dāng)好富民強(qiáng)村的促進(jìn)員,當(dāng)好群眾事務(wù)代辦員,當(dāng)好弱勢(shì)群體的救助員,當(dāng)好遠(yuǎn)程教育的操作員。時(shí)刻深入困難農(nóng)戶,了解群眾的疾苦,幫助群眾正常生活,并通過(guò)對(duì)他們的深入交流,及時(shí)確保角色轉(zhuǎn)變,消化農(nóng)村各種尖銳矛盾。對(duì)工作中遇到的一些棘手或吃不準(zhǔn)的問(wèn)題,堅(jiān)持向鄉(xiāng)黨委和村兩委早請(qǐng)示、早通氣,遇事敢于碰硬,不推諉扯皮,有效提高了工作效率和辦事能力。
三、要當(dāng)好大學(xué)生村干部必須注重實(shí)踐總結(jié)經(jīng)驗(yàn)。
篇2
1 醫(yī)學(xué)生的計(jì)算生物學(xué)與生物信息學(xué)思維培養(yǎng)
本部分特指醫(yī)學(xué)專業(yè)學(xué)生的生物信息學(xué)教學(xué),部分醫(yī)學(xué)院校開(kāi)設(shè)的醫(yī)學(xué)生物信息學(xué)專業(yè)教學(xué)將在下一部分中提及。無(wú)論是醫(yī)學(xué)基礎(chǔ)研究,還是以循證醫(yī)學(xué)為代表的臨床研究,生命科學(xué)研究的一般過(guò)程,都遵循發(fā)現(xiàn)問(wèn)題資料查詢預(yù)實(shí)驗(yàn)提出科學(xué)假設(shè)設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證假說(shuō)資料查詢和結(jié)果分析科學(xué)理論總結(jié)的基本思路[3]。在這個(gè)過(guò)程中,計(jì)算生物學(xué)與生物信息學(xué)不僅是進(jìn)行資料查詢和結(jié)果分析的重要工具,更應(yīng)是在提出科學(xué)假設(shè)和實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)階段就需要貫徹執(zhí)行的理念和思維方式。換言之,具體的生物信息學(xué)與分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)一樣都是驗(yàn)證生物醫(yī)學(xué)假說(shuō)的實(shí)驗(yàn)方法,是將一個(gè)生命科學(xué)假設(shè)用計(jì)算和信息學(xué)思維方式表達(dá)和實(shí)現(xiàn)的過(guò)程。在我國(guó),絕大部分醫(yī)學(xué)基礎(chǔ)研究和臨床研究課題都是由醫(yī)學(xué)院校畢業(yè)的臨床工作者設(shè)計(jì)和申請(qǐng)的。由于臨床醫(yī)師大都承擔(dān)了繁重的臨床工作,申請(qǐng)者親自完成課題的機(jī)會(huì)很少,獲批課題的具體實(shí)施及數(shù)據(jù)管理、存儲(chǔ)、檢索、分析和整合多由研究生或?qū)嶒?yàn)室工作人員負(fù)責(zé)。因此結(jié)合我國(guó)的實(shí)際情況,將生物信息學(xué)與具體課題耦合,即將一個(gè)科學(xué)假設(shè)用計(jì)算和信息學(xué)表示并有效實(shí)施的思維和實(shí)踐培訓(xùn),才是醫(yī)學(xué)生生物信息學(xué)培訓(xùn)的中心內(nèi)容。由于我國(guó)臨床醫(yī)學(xué)教學(xué)采用長(zhǎng)學(xué)制(5年、7年或8年)教學(xué),對(duì)實(shí)踐性和針對(duì)性都很強(qiáng)的生物信息學(xué)而言,過(guò)早或過(guò)于籠統(tǒng)的培訓(xùn)都顯得意義不大,所以筆者認(rèn)為針對(duì)醫(yī)學(xué)生的生物信息學(xué)培訓(xùn)安排在研究生階段是比較合適的,教育中心是以醫(yī)學(xué)研究需求為指導(dǎo),強(qiáng)調(diào)信息學(xué)思維培訓(xùn)和實(shí)踐操作。具體提出的建議有兩點(diǎn),一是根據(jù)學(xué)生專業(yè)背景調(diào)整理論教學(xué)內(nèi)容。醫(yī)學(xué)院校學(xué)生的數(shù)理基礎(chǔ)、計(jì)算機(jī)基礎(chǔ)及統(tǒng)計(jì)學(xué)理論基礎(chǔ)不能和工科院校的學(xué)生相比,醫(yī)學(xué)專業(yè)包括基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、臨床醫(yī)學(xué)、口腔、預(yù)防等專業(yè),涉及廣泛,各個(gè)專業(yè)背景的學(xué)生對(duì)這門課程的需求不盡相同。因此在理論課程上,要根據(jù)不同的專業(yè)背景和研究?jī)?nèi)容形成“個(gè)性化”的培養(yǎng)方案,目的是讓學(xué)生有選擇有針對(duì)性地掌握相關(guān)生物信息學(xué)內(nèi)容,例如數(shù)據(jù)庫(kù)的類型和選擇,常用軟件的種類和應(yīng)用等,同時(shí)又不會(huì)對(duì)過(guò)于高深的生物信息學(xué)理論產(chǎn)生反感。二是結(jié)合研究生階段的課題,開(kāi)展研究?jī)?nèi)容模擬和實(shí)踐操作練習(xí)。為了更好的配合研究生階段的課題,可將《生物信息學(xué)》開(kāi)課時(shí)間調(diào)整到研究生階段的第三學(xué)期,即在學(xué)生進(jìn)入課題研究階段之后,讓學(xué)生在清楚面臨的課題內(nèi)容后,有針對(duì)性地學(xué)習(xí)在完成課題過(guò)程中要使用到的知識(shí)、工具和解決問(wèn)題的思路,包括文獻(xiàn)查閱、保存、編輯,核酸序列查找和同源性比對(duì)及進(jìn)化分析,PCR引物設(shè)計(jì),基因功能、結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè),調(diào)控元件及轉(zhuǎn)錄因子預(yù)測(cè),蛋白質(zhì)基本理化性質(zhì)分析,跨膜區(qū)及信號(hào)肽預(yù)測(cè),二級(jí)結(jié)構(gòu)和空間三維結(jié)構(gòu)的預(yù)測(cè)等。這樣學(xué)生的學(xué)習(xí)興趣和效率會(huì)大大提高。為了解決上課時(shí)間與課題時(shí)間沖突的問(wèn)題,可以采用生物信息學(xué)授課老師加入導(dǎo)師組成員,通過(guò)網(wǎng)上教學(xué)和答疑、夜間授課、集中授課與個(gè)別指導(dǎo)結(jié)合等多種方式靈活解決。
2 以醫(yī)學(xué)為中心的生物信息學(xué)專業(yè)人才培養(yǎng)
如果說(shuō)對(duì)醫(yī)學(xué)生進(jìn)行生物信息學(xué)教育的目的是使其學(xué)會(huì)將一個(gè)生命科學(xué)假設(shè)用計(jì)算和信息學(xué)表示,并正確提供初始數(shù)據(jù),那么以醫(yī)學(xué)為中心的生物信息學(xué)專業(yè)人才培養(yǎng)的目的,就是使其學(xué)會(huì)用計(jì)算機(jī)學(xué)和信息學(xué)處理并證實(shí)科學(xué)假設(shè)的過(guò)程。具體的內(nèi)容包括,與實(shí)驗(yàn)室工作人員和臨床醫(yī)生配合,從計(jì)算生物學(xué)與生物信息學(xué)角度指導(dǎo)并幫助其完成科學(xué)假設(shè)和課題內(nèi)容設(shè)計(jì);在課題實(shí)施階段對(duì)后者提供的初始數(shù)據(jù)進(jìn)行管理、存儲(chǔ)、檢索、分析和整合,以及滿足后者更高要求的計(jì)算機(jī)技術(shù)的需求,例如應(yīng)用軟件的設(shè)計(jì),生物系統(tǒng)和結(jié)構(gòu)的建模,等等。目前,計(jì)算生物學(xué)與生物信息學(xué)專業(yè)研究生的培養(yǎng)模式主要有3種:①以生物學(xué)為中心的多學(xué)科培養(yǎng)模式。理論教育以生物學(xué)為中心,在6~9個(gè)學(xué)期內(nèi)陸續(xù)完成生物學(xué)部分課程(相當(dāng)于普通生物學(xué)系1/3~1/4課程)的選修,然后根據(jù)興趣和實(shí)際情況選擇一個(gè)相關(guān)實(shí)驗(yàn)室完成研究生課題。這種培養(yǎng)模式被大多數(shù)綜合大學(xué)采納。②以工程設(shè)計(jì)為中心的培養(yǎng)模式。③以醫(yī)學(xué)為中心的培養(yǎng)模式。指以醫(yī)學(xué)研究和臨床應(yīng)用為中心設(shè)置計(jì)算生物學(xué)和生物信息學(xué),絕大多數(shù)由醫(yī)學(xué)院校設(shè)置,側(cè)重生物信息學(xué)與臨床醫(yī)學(xué)的結(jié)合。在進(jìn)入課題階段之前會(huì)有1~2年臨床相關(guān)概念和信息的培訓(xùn),主要開(kāi)設(shè)的課程包括生物學(xué)、細(xì)胞生物學(xué)、分子生物學(xué)與基因組學(xué)、化學(xué)與物理學(xué)、計(jì)算機(jī)科學(xué)、數(shù)學(xué)和統(tǒng)計(jì)學(xué)等,甚至包括部分醫(yī)學(xué)課程,后期實(shí)踐階段通常選擇一個(gè)相關(guān)實(shí)驗(yàn)室完成研究生課題??偟目磥?lái),醫(yī)學(xué)生物信息學(xué)基礎(chǔ)課程設(shè)置與國(guó)際趨勢(shì)相符,也符合以醫(yī)學(xué)為中心計(jì)算生物學(xué)與生物信息學(xué)的培訓(xùn)要求。但從近年生物信息學(xué)專業(yè)研究生就業(yè)情況來(lái)看,確實(shí)存在素質(zhì)參差不齊,學(xué)不能致用,不能很快融入研究工作等問(wèn)題。筆者認(rèn)為,這種現(xiàn)象可以從三個(gè)方面加以改進(jìn):①以職業(yè)發(fā)展和學(xué)位教育為導(dǎo)向,建立多層次、多形式的醫(yī)學(xué)信息學(xué)教育和繼續(xù)教育體系。各醫(yī)學(xué)院??稍诮y(tǒng)一專業(yè)培養(yǎng)目標(biāo)和定位的基礎(chǔ)上,根據(jù)自身的學(xué)科基礎(chǔ)和特色,結(jié)合學(xué)生畢業(yè)后的工作領(lǐng)域和就業(yè)方向,形成“個(gè)性化”的專業(yè)方向和培養(yǎng)方案。②加強(qiáng)師資力量的建設(shè),形成以課程為中心的教學(xué)團(tuán)隊(duì)。現(xiàn)有醫(yī)學(xué)生物學(xué)教材內(nèi)容寬泛、偏重理論,對(duì)實(shí)踐環(huán)節(jié)的指導(dǎo)較少,需要授課老師有選擇的挑選合適的內(nèi)容并予以補(bǔ)充和完善。這對(duì)授課教師的素質(zhì)提出了更高要求,要求其能根據(jù)實(shí)際情況因材施教,有所取舍,強(qiáng)化重點(diǎn)。目前,各院校教學(xué)團(tuán)隊(duì)和師資力量配備受限,建議可以課程為中心,培養(yǎng)、引進(jìn)學(xué)術(shù)帶頭人,從其他專業(yè)挑選骨干教師兼任等多種形式,形成以課程為中心的教學(xué)團(tuán)隊(duì)。③實(shí)踐教學(xué)與綜合能力的培養(yǎng)。生物信息學(xué)是一門實(shí)踐性非常強(qiáng)的學(xué)科,要將“學(xué)有所長(zhǎng),學(xué)以致用”作為人才培養(yǎng)的最終目的??梢酝ㄟ^(guò)構(gòu)建開(kāi)放式實(shí)踐教學(xué)平臺(tái),建設(shè)實(shí)踐教學(xué)基地等方式盡可能強(qiáng)化實(shí)踐操作訓(xùn)練[4],后期部分學(xué)生可以結(jié)合個(gè)人興趣,本著雙向選擇的原則,將實(shí)踐階段訓(xùn)練固定到導(dǎo)師和實(shí)驗(yàn)室,并安排其參與完成某一項(xiàng)課題的設(shè)計(jì)、實(shí)施和總結(jié),在整個(gè)過(guò)程中要特別注意培養(yǎng)學(xué)生的學(xué)習(xí)興趣和自學(xué)能力,強(qiáng)調(diào)知識(shí)的自我更新。
綜上所述,醫(yī)學(xué)生物信息學(xué)人才培養(yǎng)的最終目的是使生物信息學(xué)能滿足現(xiàn)代醫(yī)療和醫(yī)學(xué)研究發(fā)展的需要,使醫(yī)學(xué)生物信息學(xué)人才成為有效連接基礎(chǔ)研究與臨床醫(yī)療的橋梁,為現(xiàn)代醫(yī)學(xué)的發(fā)展提供新途徑[5]。
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篇3
生物信息學(xué)是20世紀(jì)80年代末隨著人類基因組計(jì)劃的啟動(dòng)而興起的一門新的交叉學(xué)科[1-2]。它包含了生物信息的獲取、處理、儲(chǔ)存、分發(fā)、分析和解釋等在內(nèi)的所有方面;綜合運(yùn)用數(shù)學(xué)、計(jì)算機(jī)科學(xué)和生物學(xué)的各種工具,來(lái)闡明和理解大量數(shù)據(jù)所包含的生物學(xué)意義。目前,生物信息學(xué)在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域中已廣泛應(yīng)用于基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、臨床醫(yī)學(xué)及藥學(xué)等多個(gè)學(xué)科。特別在科學(xué)研究工作中,生物信息學(xué)的作用逐步顯現(xiàn),越來(lái)越受到重視。近期,精準(zhǔn)醫(yī)療概念的提出與相應(yīng)模式的推進(jìn),進(jìn)一步強(qiáng)化了運(yùn)用生物信息學(xué)工具的要求。精準(zhǔn)醫(yī)療是將臨床信息、患者表型與基因蛋白譜進(jìn)行整合,從而為患者量身制定精準(zhǔn)診斷、預(yù)后及治療策略。因此在高通量測(cè)序產(chǎn)生數(shù)以萬(wàn)計(jì)的龐大組學(xué)數(shù)據(jù)中,只有依托生物信息學(xué)技術(shù),才能探尋基因突變、藥物靶向等隱含遺傳學(xué)奧秘的精確位點(diǎn),進(jìn)而提供可靠的個(gè)性化治療方案。可見(jiàn),生物信息學(xué)是精準(zhǔn)醫(yī)療的核心內(nèi)容之一。當(dāng)前,大多數(shù)醫(yī)學(xué)院校均已開(kāi)設(shè)研究生生物信息學(xué)課程,但尚未將生物信息學(xué)正式列入本科生培養(yǎng)方案,以選修課形式開(kāi)設(shè)生物信息學(xué)課程的院校也極為鮮見(jiàn)。醫(yī)學(xué)本科生是祖國(guó)醫(yī)學(xué)的未來(lái),是臨床一線最直接的儲(chǔ)備軍,面對(duì)飛速發(fā)展的生物技術(shù)和以幾何級(jí)數(shù)增長(zhǎng)的生物大數(shù)據(jù),如果現(xiàn)階段的醫(yī)學(xué)本科生還不能學(xué)會(huì)如何利用和解讀這些資源,這將大大阻礙臨床醫(yī)學(xué)的發(fā)展。綜上,一方面醫(yī)學(xué)領(lǐng)域?qū)ι镄畔W(xué)方面存在旺盛的需求,另一方面大多數(shù)院校均未正式開(kāi)設(shè)本科生生物信息學(xué)課程,造成生物信息學(xué)人才極度緊缺。針對(duì)這一現(xiàn)狀,筆者近年來(lái)圍繞在研的各項(xiàng)科研課題,選拔學(xué)有余力的優(yōu)秀學(xué)生,在學(xué)校開(kāi)展的各項(xiàng)大學(xué)生科研能力訓(xùn)練、創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)項(xiàng)目支持下,吸收本科生進(jìn)入實(shí)驗(yàn)室,對(duì)醫(yī)學(xué)類本科生的生物信息學(xué)教學(xué)實(shí)踐方面做了一些嘗試,培養(yǎng)了一些初步掌握生物信息學(xué)知識(shí)與方法的本科學(xué)生。在此對(duì)教學(xué)過(guò)程中的感想和體會(huì)做一簡(jiǎn)要總結(jié),并對(duì)本科生生物信息學(xué)的教學(xué)模式進(jìn)行了探討。
一、在醫(yī)學(xué)本科生中開(kāi)展生物信息學(xué)的教學(xué)實(shí)踐
(一)尊重學(xué)生的教育主體地位,實(shí)施因材施教
由于生物信息學(xué)涵蓋了計(jì)算機(jī)科學(xué)、統(tǒng)計(jì)學(xué)、分子生物學(xué)和分子遺傳學(xué)等諸多學(xué)科相關(guān)知識(shí),所以一般情況下生物信息學(xué)科研實(shí)踐的開(kāi)展要遲于上述各門課程。在開(kāi)展的過(guò)程中,要充分考慮學(xué)生的自身?xiàng)l件,進(jìn)行分組施教。因?yàn)椴煌瑢W(xué)生對(duì)相關(guān)背景知識(shí)的掌握不同,會(huì)導(dǎo)致他們接受相關(guān)教學(xué)內(nèi)容的快慢程度不一樣,因此要針對(duì)不同層次的學(xué)生開(kāi)設(shè)不同等級(jí)的實(shí)踐內(nèi)容。此外,根據(jù)學(xué)生將來(lái)從事的工作類型導(dǎo)致的對(duì)生物信息學(xué)的需求不同,可有針對(duì)性地分成科研組和臨床組。如有些學(xué)生將來(lái)可能主要從事科研工作,因此希望掌握較多的生物信息學(xué)知識(shí),包括各種計(jì)算機(jī)語(yǔ)言的使用、編程、復(fù)雜統(tǒng)計(jì)軟件的使用等等,這類學(xué)生學(xué)習(xí)熱情比較高漲。
(二)構(gòu)建多學(xué)科教師組成的教學(xué)團(tuán)隊(duì),實(shí)現(xiàn)知識(shí)的互補(bǔ)與整合
由于生物信息學(xué)是一門新興的交叉學(xué)科,需要計(jì)算機(jī)學(xué)、統(tǒng)計(jì)學(xué)、醫(yī)學(xué)生物化學(xué)、醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)等相關(guān)學(xué)科的共同發(fā)展來(lái)支撐。此外,生物信息學(xué)專業(yè)知識(shí)較為前沿,而且涉及的醫(yī)學(xué)研究領(lǐng)域較多。再加上目前生物信息學(xué)的專業(yè)教師缺少,這就限制了學(xué)科的發(fā)展。因此,在教學(xué)過(guò)程中應(yīng)該合理組建教學(xué)團(tuán)隊(duì),授課教師需要來(lái)自不同的專業(yè),了解本專業(yè)最新的知識(shí),教師之間相互學(xué)習(xí)溝通,將不同學(xué)科的相關(guān)知識(shí)整合起來(lái)[3],并需持續(xù)補(bǔ)充和學(xué)習(xí)生物信息學(xué)前沿知識(shí),在授課內(nèi)容上還要體現(xiàn)教師自身優(yōu)勢(shì)。這樣不但可以在知識(shí)結(jié)構(gòu)上互補(bǔ),還可以滿足不同專業(yè)學(xué)生的需求。
(三)圍繞教師在研科研課題和學(xué)術(shù)會(huì)議,追蹤醫(yī)學(xué)研究前沿
生物信息學(xué)是一門快速發(fā)展的學(xué)科。近年來(lái)計(jì)算機(jī)技術(shù)、生物技術(shù)以及醫(yī)學(xué)技術(shù)及醫(yī)療模式都在快速更新。因此醫(yī)學(xué)生生物信息學(xué)實(shí)踐教學(xué)不能拘泥于原有教材。在進(jìn)行基礎(chǔ)和共性的知識(shí)教學(xué)時(shí)要利用教材。而對(duì)于前沿的知識(shí),教師一方面要結(jié)合在研的各項(xiàng)科研課題引入知識(shí)點(diǎn),另一方面可帶學(xué)生參加一些與生物信息學(xué)相關(guān)的學(xué)術(shù)會(huì)議,讓他們開(kāi)闊眼界,增長(zhǎng)見(jiàn)識(shí),激發(fā)科研靈感。
(四)調(diào)動(dòng)學(xué)生主觀能動(dòng)性,激發(fā)其學(xué)習(xí)潛能
由于學(xué)生專業(yè)背景知識(shí)掌握程度差異較大,以及學(xué)生自身興趣不同,傳統(tǒng)的大班教學(xué)較難達(dá)到一致性的教學(xué)效果。因此,在教學(xué)過(guò)程中可以采取不同的分組方式以滿足學(xué)生不同的需求。由于現(xiàn)階段生物信息人才非常缺乏,因此在教學(xué)過(guò)程中,對(duì)于個(gè)別基礎(chǔ)較強(qiáng)的學(xué)生,教師可以有針對(duì)性地對(duì)他們進(jìn)行一些更深層次的培養(yǎng),充分挖掘?qū)W生的潛力,利用課余時(shí)間,合理安排一些“實(shí)戰(zhàn)”性任務(wù),通過(guò)實(shí)踐鍛煉,提升他們的專業(yè)科研素質(zhì),為當(dāng)代生物信息學(xué)的發(fā)展培養(yǎng)特色人才。如我校2009級(jí)臨床專業(yè)熊同學(xué)、2010級(jí)藥學(xué)專業(yè)本科生熊同學(xué),都對(duì)生物信息學(xué)興趣非常濃厚,在科研實(shí)踐中表現(xiàn)得十分出色,充分利用課余和寒暑假時(shí)間,在老師的精心指導(dǎo)下,用perl語(yǔ)言成功編寫出分析組學(xué)數(shù)據(jù)的一系列程序。在研究生面試時(shí),他們?cè)鷮?shí)的生物信息學(xué)功底獲得導(dǎo)師的青睞,并成功讀取/保送了國(guó)內(nèi)知名大學(xué)的研究生。
二、醫(yī)學(xué)本科生生物信息學(xué)教學(xué)方法、教學(xué)模式的探討
(一)PBL教學(xué)法在案例教學(xué)中的應(yīng)用
PBL(Problem-BasedLearning)教學(xué)法[4],也稱作問(wèn)題式學(xué)習(xí)。生物信息學(xué)是一門操作性和實(shí)驗(yàn)性很強(qiáng)的學(xué)科,要利用互聯(lián)網(wǎng)、計(jì)算機(jī)和各種生物信息學(xué)數(shù)據(jù)處理軟件來(lái)解決實(shí)際問(wèn)題。目前,生物信息學(xué)已成為生命科學(xué)研究領(lǐng)域的重要工具。在實(shí)際訓(xùn)練中應(yīng)以問(wèn)題為導(dǎo)向,針對(duì)每個(gè)知識(shí)點(diǎn)盡量從實(shí)際的應(yīng)用案例出發(fā),引導(dǎo)學(xué)生自主探究、合作學(xué)習(xí)、進(jìn)行交流。注重培養(yǎng)學(xué)生的實(shí)際操作能力和解決問(wèn)題的能力,使學(xué)生能在解決問(wèn)題的過(guò)程中學(xué)會(huì)各種技能,如統(tǒng)計(jì)方法、計(jì)算機(jī)語(yǔ)言和軟件的基本使用、編程技巧及數(shù)據(jù)庫(kù)的運(yùn)用等。隨著生物信息學(xué)技術(shù)的快速發(fā)展,整合不同生物技術(shù)產(chǎn)生的數(shù)據(jù)將有利于人們發(fā)現(xiàn)疾病致病相關(guān)位點(diǎn)和藥物作用靶點(diǎn)。在本實(shí)驗(yàn)室開(kāi)展的PBL教學(xué)實(shí)踐中,我們以代謝性疾病作為主要研究方向,對(duì)糖尿病、高膽固醇血癥及肝癌等展開(kāi)了疾病相關(guān)基因/位點(diǎn)的全基因組篩查。
(二)在教學(xué)過(guò)程中發(fā)揮優(yōu)秀學(xué)生的引領(lǐng)作用,以點(diǎn)帶面
由于生物信息學(xué)在醫(yī)學(xué)研究中的重要性逐漸凸現(xiàn),因此要求參加科研實(shí)踐培訓(xùn)的學(xué)生人數(shù)逐年增多。而目前生物信息學(xué)專業(yè)的老師相對(duì)缺乏,為了解決這一矛盾,我們?cè)趯?shí)踐教學(xué)和科研中摸索出一種新的方法,即以“導(dǎo)師-學(xué)生雙向選擇制”遴選學(xué)生進(jìn)入老師課題組后,以優(yōu)秀學(xué)生為中心,采用以點(diǎn)及面式訓(xùn)練。與以往的老師帶學(xué)生做試驗(yàn)的傳統(tǒng)模式不同,在培訓(xùn)中教師除作為指導(dǎo)老師外,還要善于在眾多的學(xué)生中發(fā)現(xiàn)優(yōu)秀的人才,并對(duì)這些有天分的學(xué)生進(jìn)行精細(xì)培養(yǎng),然后以這些人才為中心點(diǎn),進(jìn)行放大,即由一個(gè)優(yōu)秀的學(xué)生指導(dǎo)幾個(gè)后參加培訓(xùn)的學(xué)生,在這幾個(gè)學(xué)生中再選出優(yōu)秀的學(xué)生作為下一輪的指導(dǎo)“老師”,這種以點(diǎn)帶面的特色實(shí)踐教學(xué)模式不但能節(jié)約大量教學(xué)資源,而且將最大限度地挖掘?qū)W生的科研潛力,有利于培養(yǎng)學(xué)生的科研創(chuàng)新素質(zhì)。
(三)以大學(xué)生的各類科研訓(xùn)練、創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)項(xiàng)目為載體開(kāi)展教學(xué)活動(dòng)
目前,科技創(chuàng)新已成為發(fā)達(dá)國(guó)家保持持久競(jìng)爭(zhēng)力的“法寶”。中國(guó)早在若干年前就確立了“科技興國(guó)”的戰(zhàn)略目標(biāo)。大學(xué)生是祖國(guó)的未來(lái),大學(xué)生科研創(chuàng)新能力的培養(yǎng)是21世紀(jì)高校人才培養(yǎng)的核心內(nèi)容。國(guó)內(nèi)外眾多高校都開(kāi)展了多種形式的大學(xué)生創(chuàng)新訓(xùn)練計(jì)劃。因此,將生物信息學(xué)科研訓(xùn)練與學(xué)校開(kāi)展的各類科研創(chuàng)新訓(xùn)練計(jì)劃(如大學(xué)生“挑戰(zhàn)杯”、“創(chuàng)新學(xué)分”或“大學(xué)生創(chuàng)新性實(shí)驗(yàn)計(jì)劃”等)相結(jié)合,將更加有效地利用各種資源,全面鍛煉學(xué)生的科研創(chuàng)新能力,例如,文獻(xiàn)的檢索與閱讀,各種組學(xué)數(shù)據(jù)的收集、處理和分析,程序的編寫,實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)和操作,科研項(xiàng)目書的撰寫,科研論文的書寫等。
(四)同步開(kāi)展科技文書的寫作訓(xùn)練,總結(jié)成果保持學(xué)生的熱情
疾病的發(fā)生發(fā)展與特異基因的改變密切相關(guān),鑒定與疾病相關(guān)的基因是醫(yī)學(xué)科研工作的重要內(nèi)容之一。在科研實(shí)踐訓(xùn)練中,學(xué)生利用生物信息學(xué)方法,通過(guò)分析處理感興趣的數(shù)據(jù)(如基因組、轉(zhuǎn)錄組、單核苷酸多態(tài)性、全基因組關(guān)聯(lián)分析等),可挖掘出一些與疾病相關(guān)的內(nèi)在信息,或再通過(guò)實(shí)驗(yàn)對(duì)分析結(jié)果加以驗(yàn)證。教師可鼓勵(lì)學(xué)生將這些階段性的成果進(jìn)行發(fā)表,這對(duì)學(xué)生來(lái)說(shuō)是一種能力上的認(rèn)可,可以增加學(xué)生的科研信心,激發(fā)他們的科研熱情和動(dòng)力。此外還要鼓勵(lì)學(xué)生積極申請(qǐng)學(xué)校乃至全國(guó)性的大學(xué)生“挑戰(zhàn)杯”等競(jìng)賽。培養(yǎng)學(xué)生的創(chuàng)新和挑戰(zhàn)激情,以便激勵(lì)他們?cè)诳蒲兄飞夏茉賱?chuàng)新高。如我校2012級(jí)本科生王同學(xué),從大學(xué)一年級(jí)開(kāi)始就進(jìn)入實(shí)驗(yàn)室學(xué)習(xí)生物信息學(xué)分析數(shù)據(jù),勤奮鉆研,已分別于2013和2014年發(fā)表了2篇核心文章,并已成功申請(qǐng)到我校大學(xué)生“挑戰(zhàn)杯”項(xiàng)目,在我校大學(xué)生作品“挑戰(zhàn)杯”競(jìng)賽中獲得二等獎(jiǎng)。這些成果極大地鼓舞了同學(xué)們的科研熱情。
三、本科生生物信息學(xué)科研實(shí)踐中存在的問(wèn)題
隨著生物信息學(xué)在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的廣泛應(yīng)用,越來(lái)越多的學(xué)生意識(shí)到這門學(xué)科的重要性,都積極參與實(shí)踐練習(xí)。而生物信息學(xué)實(shí)踐離不開(kāi)計(jì)算機(jī)這一硬件設(shè)備,同時(shí)由于生物數(shù)據(jù)量龐大,這就要求較高的計(jì)算機(jī)的配置。此外,現(xiàn)階段生物信息學(xué)專業(yè)教師比較缺乏,在一定程度上也會(huì)影響教學(xué)實(shí)踐的開(kāi)展。因此,對(duì)醫(yī)學(xué)本科生開(kāi)展生物信息學(xué)實(shí)踐訓(xùn)練尚需相關(guān)資源的配套和完善。
四、結(jié)語(yǔ)
本文主要探討了對(duì)醫(yī)學(xué)本科生開(kāi)展生物信息學(xué)科研實(shí)踐過(guò)程中的一些感想和體會(huì),并在多年教學(xué)實(shí)踐基礎(chǔ)上,總結(jié)出一種以科研為核心、學(xué)生為主體、訓(xùn)練項(xiàng)目為載體的科研實(shí)訓(xùn)教學(xué)模式。當(dāng)前雖然一些醫(yī)學(xué)院校已經(jīng)開(kāi)設(shè)了生物信息學(xué)課程,但是在教學(xué)內(nèi)容、教學(xué)方法和教學(xué)模式上還有很多不足,尚有待進(jìn)一步的摸索和改進(jìn)[5-6]。此外,我們要加大硬件設(shè)施的投入,并不斷加強(qiáng)師資隊(duì)伍建設(shè),積極參與教學(xué)改革,整合各種教學(xué)力量,從而提高生物信息學(xué)教學(xué)質(zhì)量。
致謝:感謝南昌大學(xué)醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)教學(xué)中心汪雁老師生前對(duì)本科生生物信息學(xué)教學(xué)方面的貢獻(xiàn)!
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篇4
一、師范院校研究生生物信息學(xué)課程教學(xué)中存在的問(wèn)題
(一)教材選擇少
碩士研究生培養(yǎng)有其自身的特點(diǎn),需要學(xué)生系統(tǒng)掌握某學(xué)科或?qū)I(yè)領(lǐng)域內(nèi)專門知識(shí)和基礎(chǔ)理論。這就要求研究生既要擁有廣泛深厚的專業(yè)知識(shí),也應(yīng)具備一定研究與創(chuàng)造能力。對(duì)于非生物信息學(xué)專業(yè)的師范院校研究生,我們要求其既掌握基本的生物信息學(xué)知識(shí),同時(shí)具備一定的數(shù)據(jù)分析處理能力。目前本科院校生物信息專業(yè)常用的教材講的比較深入,對(duì)于非專業(yè)的研究生來(lái)說(shuō),由于缺乏較好的數(shù)學(xué)和計(jì)算機(jī)基礎(chǔ),學(xué)習(xí)起來(lái)稍顯吃力。但是普通生物信息學(xué)教程大多講的較寬泛,也不適合研究生教學(xué)。如果能夠編纂既能普及學(xué)生的生物信息學(xué)知識(shí),同時(shí)又能讓其具備基本的數(shù)據(jù)收集、整理和分析能力的教材將非常有利,但是目前市面上該類教材還比較少。
(二)師資缺乏
目前,國(guó)內(nèi)大部分師范院校將生物信息學(xué)作為選修課來(lái)開(kāi)設(shè),使得課程在專業(yè)建設(shè)和人才培養(yǎng)方案中的地位偏低,造成對(duì)該類教師的師資培養(yǎng)不夠重視。且大部分師范院校未配備專業(yè)的生物信息學(xué)教師,多為其他生物專業(yè)的教師兼職講授,該類教師部分通過(guò)自學(xué),部分通過(guò)進(jìn)修,缺乏專業(yè)系統(tǒng)的生物信息學(xué)培訓(xùn),因此在教學(xué)過(guò)程中不能很好滿足教學(xué)要求。
(三)學(xué)生基礎(chǔ)水平參差不齊
師范院校研究生來(lái)源途徑廣,除了本科師范院校外,還有一部分來(lái)自農(nóng)林院?;蚓C合院校,學(xué)生本科所學(xué)專業(yè)不同,生物學(xué)基礎(chǔ)和對(duì)生物信息學(xué)的認(rèn)知程度差異較大,這些問(wèn)題都會(huì)成為教學(xué)中的影響因素,這就要求授課教師能夠在授課內(nèi)容上不僅做到完成教學(xué)要求,同時(shí)要兼顧學(xué)生基礎(chǔ)水平參差不齊的現(xiàn)象,使學(xué)生更好的對(duì)該門課程有很好的把握。
二、教學(xué)改革思考
(一)選擇合適的教材和教輔資料完善教學(xué)廣度和深度
不同院校不同的教師研究方向不同,但是大致都離不開(kāi)動(dòng)物、植物、微生物、生態(tài)這些大類,生物信息學(xué)作為一門工具學(xué)科,要求研究生在學(xué)習(xí)該門課程后,能夠熟練的運(yùn)用生物信息學(xué)的知識(shí)為自己的科研服務(wù)。作為該門課程的任課教師,要求在上課之前先對(duì)學(xué)生的研究對(duì)象和研究?jī)?nèi)容進(jìn)行初步的調(diào)查,選擇能夠更好的服務(wù)于學(xué)生科研的教材和教輔資料,可以不局限于現(xiàn)有教材的內(nèi)容,必要時(shí)候可以以專題講座的形式對(duì)部分教學(xué)內(nèi)容進(jìn)行補(bǔ)充。
(二)根據(jù)學(xué)生基礎(chǔ)調(diào)整教學(xué)內(nèi)容
針對(duì)學(xué)生基礎(chǔ)層次不齊的現(xiàn)狀,授課教師可以在授課前幾章節(jié)補(bǔ)充學(xué)生的遺傳學(xué)和基礎(chǔ)分子生物學(xué)知識(shí),通過(guò)兩到三次課的時(shí)間完善學(xué)生該方面的不足,部分學(xué)生可能是農(nóng)林院校的本科生,在大學(xué)期間學(xué)習(xí)的多為專業(yè)方向比較強(qiáng)的生物學(xué)知識(shí),那么通過(guò)普及基礎(chǔ)生物學(xué)知識(shí),可以讓其對(duì)整個(gè)生物學(xué)有一個(gè)整體的了解。同樣對(duì)于師范院校的本科生,通過(guò)該段授課,也可以將自己在大學(xué)學(xué)到的各門專業(yè)課有一個(gè)整體的脈絡(luò)和認(rèn)識(shí),起到提綱挈領(lǐng)的作用。通過(guò)這個(gè)過(guò)程,學(xué)生對(duì)基礎(chǔ)分子生物學(xué)及基本的遺傳學(xué)思想不再陌生,再學(xué)習(xí)后邊的生物信息學(xué)知識(shí)的時(shí)候就不會(huì)顯得很吃力。同時(shí)由于學(xué)生研究方向不同,對(duì)生物信息學(xué)技術(shù)的需求也不一樣。針對(duì)此,授課教師可以在講授過(guò)程中,穿插列舉一些學(xué)生科研終于到的一些問(wèn)題,應(yīng)用所學(xué)的生物信息學(xué)知識(shí)進(jìn)行解決,而不是僅僅局限于教材所舉實(shí)例。同時(shí)對(duì)于前沿技術(shù)的內(nèi)容,也必須做及時(shí)補(bǔ)充和更新,使學(xué)生更好的把握生物信息的前沿和技術(shù)。
(三)利用現(xiàn)有的多媒體資源改進(jìn)教學(xué)方式
作為一門實(shí)用性很強(qiáng)的課程,生物信息學(xué)教學(xué)有其自身的特點(diǎn)。它不僅要求學(xué)生有較強(qiáng)的理論知識(shí),同時(shí)要求其必須有較強(qiáng)的上機(jī)操作能力。且大部分課程知識(shí)在講授過(guò)程中如果只是單純的教師操作演示不能起到好的教學(xué)效果,畢竟觀看和臨摹效果是截然不同的。因此在教學(xué)中,可以將生物信息學(xué)教學(xué)分成理論授課和上機(jī)實(shí)踐兩部分,有些操作性較強(qiáng)的章節(jié)可以直接選擇在機(jī)房講授,讓學(xué)生在聽(tīng)課過(guò)程中通過(guò)自己操作增強(qiáng)感性認(rèn)識(shí),以利于更好的對(duì)知識(shí)進(jìn)行掌握。
篇5
我國(guó)目前醫(yī)學(xué)研究生教學(xué)模式主要有兩種, 一是醫(yī)學(xué)本科教育延續(xù)過(guò)來(lái)的理論型, 這種類型 的教育是在本科教學(xué)大綱的基礎(chǔ)上, 按照教學(xué)計(jì)劃進(jìn)行理論講授, 最后按照導(dǎo)師指定的課題 完成畢業(yè)論文。這種培養(yǎng)模式突出理論學(xué)習(xí), 忽視了實(shí)驗(yàn)機(jī)能和科研能力的培養(yǎng)。二是科研 能力培養(yǎng)的前輕后重型, 前期只是進(jìn)行理論授課, 后期由導(dǎo)師指導(dǎo)學(xué)生的科研。這種模式雖 然開(kāi)設(shè)了一定的實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目, 但對(duì)研究生科研能力的培養(yǎng)缺乏系統(tǒng)性, 并且前期的培養(yǎng)不足直 接影響到研究生后期的學(xué)位課題和論文的進(jìn)度、質(zhì)量。
因此,筆者對(duì)生物信息學(xué)在醫(yī)學(xué)碩士研究生中的教育初探,不但有利于該門課程尚未完全形 成成熟的課程體系之際,為教師學(xué)習(xí)借鑒先進(jìn)的教育思想與教學(xué)實(shí)踐經(jīng)驗(yàn),更有利于醫(yī)學(xué)碩 士研究生對(duì)生物信息學(xué)的學(xué)習(xí)。
1 生物信息學(xué)的研究范圍
生物信息學(xué)是一門新興的交叉學(xué)科,涉及生物學(xué)、數(shù)學(xué)和信息科學(xué)等學(xué)科領(lǐng)域,并注定以互 聯(lián)網(wǎng)為媒介,數(shù)據(jù)庫(kù)為載體,利用數(shù)學(xué)知識(shí)、各種計(jì)算模型,并以計(jì)算機(jī)為工具,進(jìn)行各種 生物信息分析,以理解海量分子數(shù)據(jù)中的生物學(xué)含義。
生物信息包括多種類型的數(shù)據(jù),如核酸和蛋白質(zhì)序列、蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)和三級(jí)結(jié)構(gòu)的數(shù)據(jù)等 。由實(shí)驗(yàn)獲得的核酸蛋白序列和三維結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)等構(gòu)成初級(jí)數(shù)據(jù),由此構(gòu)建的數(shù)據(jù)庫(kù)稱初級(jí)數(shù) 據(jù)庫(kù)。由初級(jí)數(shù)據(jù)分析得來(lái)的諸如二級(jí)結(jié)構(gòu)、疏水位點(diǎn)、結(jié)構(gòu)域(Domain),由核酸序列翻譯 來(lái)的蛋白質(zhì)以及預(yù)測(cè)的二級(jí)三級(jí)結(jié)構(gòu),稱為二級(jí)數(shù)據(jù)。創(chuàng)新算法和軟件是生物信息學(xué)持續(xù)發(fā) 展的基礎(chǔ),高通量生物學(xué)研究方法和平臺(tái)技術(shù)是驗(yàn)證生物信息學(xué)研究結(jié)果的關(guān)鍵技術(shù)。因此 ,現(xiàn)代生物信息學(xué)是現(xiàn)代生命科學(xué)與信息科學(xué)、計(jì)算機(jī)科學(xué)、數(shù)學(xué)、統(tǒng)計(jì)學(xué)、物理學(xué)和化學(xué) 等學(xué)科相互滲透而形成的交叉學(xué)科,是應(yīng)用計(jì)算機(jī)技術(shù)和信息論方法研究蛋白質(zhì)及核酸序列 等各種生物信息的采集、存儲(chǔ)、傳遞、檢索、分析和解讀,以幫助了解生物學(xué)和遺傳學(xué)信息 的科學(xué)。從其研究所涉及的學(xué)科上看,生物信息學(xué)是集生物學(xué)、數(shù)學(xué)、信息學(xué)和計(jì)算機(jī)科學(xué) 一體化的一門新的科學(xué);從其研究的主要內(nèi)容上看,基因組信息學(xué)、蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)模擬以及 藥物設(shè)計(jì)是生物信息學(xué)的三個(gè)重要組成部分,并有機(jī)地結(jié)合在一起[1]。
2 醫(yī)學(xué)碩士研究生中的生物信息學(xué)教學(xué)初探
2.1 課堂教學(xué)重在教授實(shí)踐技巧與方法
生物信息學(xué)在醫(yī)學(xué)研究生中的教學(xué)應(yīng)以教授實(shí)踐技巧為主,以介紹原理為輔,深入淺出,注 重課堂知識(shí)與科研實(shí)踐的緊密結(jié)合。課堂講授應(yīng)簡(jiǎn)要介紹生物信息學(xué)的相關(guān)算法、原理,著 重介紹其使用技巧與方法,真正做到“有的放矢”,而這也是教學(xué)的重點(diǎn)和難點(diǎn)。
在教學(xué)中對(duì)于這部分內(nèi)容應(yīng)遵循深入淺出、避繁就簡(jiǎn)的原則,結(jié)合具體實(shí)例分析算法,避免 空洞復(fù)雜的算法講解讓學(xué)生覺(jué)得枯燥乏味、晦澀難懂,產(chǎn)生畏懼心理,知難而退;注重講解 使用技巧與方法的思想和來(lái)龍去脈,讓學(xué)生真正掌握解決問(wèn)題的思路,培養(yǎng)其科學(xué)思維能力 ,并采用探討式教學(xué)鼓勵(lì)學(xué)生思考,通過(guò)討論與研究的方式循序漸進(jìn)的掌握復(fù)雜的內(nèi)容,介 紹相關(guān)的教學(xué)和物理學(xué)知識(shí),使學(xué)生充分體會(huì)到生物信息學(xué)與其他學(xué)科的關(guān)系,其他學(xué)科的 思想方法對(duì)于生物科學(xué)的重要性,培養(yǎng)其自覺(jué)地將其他學(xué)科的方法和思想應(yīng)用于解決生物 學(xué)問(wèn)題的科學(xué)素質(zhì)。 任何學(xué)科都處于不斷地發(fā)展、更新中,生物信息無(wú)論是理論研究還是 應(yīng)用研究仍處于不斷發(fā)展完善中,同時(shí)隨著新的應(yīng)用領(lǐng)域和新問(wèn)題的發(fā)現(xiàn),其他學(xué)科的方 法也在不斷地應(yīng)用于生物信息學(xué),進(jìn)一步增加了其多學(xué)科交叉融合的深度和廣度。
2.2 充分利用現(xiàn)代化教育技術(shù),采用案例教學(xué)
目前,高等院校在教室內(nèi)配備的多媒體投影播放系統(tǒng),促進(jìn)了多媒體教學(xué)的廣泛應(yīng)用。生物 信息學(xué)采用多媒體教學(xué)是適應(yīng)學(xué)科特點(diǎn)、提高教學(xué)效果和充分利用現(xiàn)代化教育技術(shù)的一項(xiàng)基 本要求。作為生物信息學(xué)教學(xué)的基本模式,多媒體教學(xué)使講解的內(nèi)容更加直觀形象,尤其是 對(duì)于具體數(shù)據(jù)庫(kù)的介紹以及數(shù)據(jù)庫(kù)檢索、數(shù)據(jù)庫(kù)相似性搜索、序列分析和蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)等 內(nèi)容涉及到的具體方法和工具的講解,可以激發(fā)學(xué)生的學(xué)習(xí)興趣,加深學(xué)生對(duì)知識(shí)的理解和 掌握,提高學(xué)生理論與實(shí)踐相結(jié)合的能力。
但多媒體教室也有局限性,學(xué)生主要以聽(tīng)講為主不能及時(shí)實(shí)踐,教師講解與學(xué)生實(shí)踐相脫節(jié) ,如果將生物信息學(xué)課程安排在計(jì)算機(jī)房?jī)?nèi)進(jìn)行,并采用多媒體電子教室的教學(xué)方式可以解 決上述問(wèn)題。在教學(xué)中采用啟發(fā)式教學(xué),為學(xué)生建立教學(xué)情景,學(xué)生通過(guò)與教師、同學(xué)的協(xié) 商討論,參與操作,發(fā)現(xiàn)知識(shí),理解知識(shí)并掌握知識(shí)。例如在講授“目的基因序列的查尋” 時(shí),除對(duì)基本內(nèi)容的介紹,如數(shù)據(jù)庫(kù)的發(fā)展、分類等,其他采用案例法,讓學(xué)生利用搜索工 具查找三大公共核酸數(shù)據(jù)庫(kù),并通過(guò)數(shù)據(jù)庫(kù)網(wǎng)站的介紹內(nèi)容對(duì)該數(shù)據(jù)庫(kù)的發(fā)展、內(nèi)容、特點(diǎn) 進(jìn)行學(xué)習(xí)并總結(jié),通過(guò)討論和實(shí)際的數(shù)據(jù)庫(kù)瀏覽操作了解三大公共核酸數(shù)據(jù)庫(kù)并且掌握數(shù)據(jù) 庫(kù)使用方法。
2.3 采用“講、練”一體化的教學(xué)模式,強(qiáng)調(diào)學(xué)生實(shí)踐能力的培養(yǎng)
生物信息學(xué)課堂教學(xué)積極學(xué)習(xí)借鑒職業(yè)培訓(xùn)和計(jì)算機(jī)課程教學(xué)中“講、練、做”一體化的教 學(xué)模式,在理論教學(xué)中增加實(shí)訓(xùn)內(nèi)容,在實(shí)踐教學(xué)中結(jié)合理論講授,改變了傳統(tǒng)的“以教師 為中心、以教材和講授為中心”教學(xué)方式。
根據(jù)教學(xué)內(nèi)容和學(xué)生的認(rèn)知規(guī)律,靈活地采用先理論后實(shí)踐或先實(shí)踐后理論或邊理論邊實(shí)踐 的方法,融生物信息學(xué)理論教學(xué)與實(shí)踐操作為一體,使學(xué)生的知識(shí)和能力得到同步、協(xié)調(diào)、 綜合發(fā)展。通常采用先講后練的方法,即首先介紹原理、方法,之后設(shè)計(jì)相關(guān)的實(shí)訓(xùn)內(nèi)容 讓學(xué)生上機(jī)實(shí)踐。對(duì)于操作性內(nèi)容和生物信息分析的方法和工具的講解采取了進(jìn)行實(shí)際演示 的方法,教師邊講解邊示范,學(xué)生在聽(tīng)課時(shí)邊聽(tīng)講邊練習(xí)或者教師講解結(jié)束后學(xué)生再進(jìn)行練 習(xí),理論與實(shí)踐高度結(jié)合,充分發(fā)揮課堂教學(xué)的生動(dòng)性、直觀性,加深學(xué)生對(duì)知識(shí)的理解, 培養(yǎng)和提高學(xué)生的實(shí)踐操作能力。
2.4 發(fā)揮網(wǎng)絡(luò)教學(xué)優(yōu)勢(shì),優(yōu)化生物信息學(xué)實(shí)驗(yàn)教學(xué)內(nèi)容
生物信息學(xué)實(shí)驗(yàn)教學(xué)主要是針對(duì)海量生物數(shù)據(jù)處理與分析的實(shí)際需要,培養(yǎng)學(xué)生綜合運(yùn)用生 物信息學(xué)知識(shí)和方法進(jìn)行生物信息提取、儲(chǔ)存、處理、分析的能力,提高學(xué)生應(yīng)用理論知識(shí) 解決問(wèn)題的能力和獨(dú)立思考、綜合分析的能力。生物信息學(xué)實(shí)驗(yàn)教學(xué)內(nèi)容的選擇與安排應(yīng)按 照循序漸進(jìn)的原則,針對(duì)特定的典型性的生物信息學(xué)問(wèn)題設(shè)計(jì),以綜合性、設(shè)計(jì)性實(shí)驗(yàn)內(nèi)容 為主,明確目的要求,突出重點(diǎn),充分發(fā)揮學(xué)生的主觀能動(dòng)性和探索精神,以激發(fā)學(xué)生學(xué)習(xí) 的主動(dòng)性和創(chuàng)造性為出發(fā)點(diǎn),加強(qiáng)學(xué)生創(chuàng)新精神和實(shí)驗(yàn)?zāi)芰Φ呐囵B(yǎng)。生物信息學(xué)實(shí)驗(yàn)教學(xué)以 互聯(lián)網(wǎng)為媒介、計(jì)算機(jī)為工具,全部在計(jì)算機(jī)網(wǎng)絡(luò)實(shí)驗(yàn)室內(nèi)完成。在教學(xué)中,充分利用網(wǎng)絡(luò) 的交互特點(diǎn)實(shí)現(xiàn)信息技術(shù)與課程的結(jié)合。教師通過(guò)電子郵件將實(shí)驗(yàn)教學(xué)內(nèi)容、實(shí)驗(yàn)序列、工 具等傳遞給學(xué)生,學(xué)生同樣通過(guò)電子郵件將實(shí)驗(yàn)報(bào)告、作業(yè)、問(wèn)題和意見(jiàn)等反饋給教師,教 師在網(wǎng)上批改實(shí)驗(yàn)報(bào)告后將成績(jī)和評(píng)語(yǔ)發(fā)送給學(xué)生,讓學(xué)生及時(shí)了解自己的學(xué)習(xí)情況。
生物信息實(shí)驗(yàn)教學(xué)與現(xiàn)代網(wǎng)絡(luò)和信息技術(shù)密不可分,在教學(xué)工作中充分利用現(xiàn)代教育技術(shù)較 其他課程更具優(yōu)勢(shì)。區(qū)別于其他生命科學(xué)課程,在教學(xué)過(guò)程中要求有發(fā)達(dá)的互聯(lián)網(wǎng)和計(jì)算機(jī) 作為必備條件。調(diào)查顯示國(guó)內(nèi)高校都已建立校園網(wǎng),其中擁有1000 M主干帶寬的高校已占調(diào) 查 總數(shù)的64.9%,2005年一些綜合類大學(xué)和理工類院校將率先升級(jí)到萬(wàn)兆校園網(wǎng)[2] ,這些都為生物信息學(xué)課程在高校開(kāi)設(shè)提供了良好的物質(zhì)基礎(chǔ)。
2.5 考試無(wú)紙化,加強(qiáng)實(shí)踐能力考核
考試重點(diǎn)是考查學(xué)生對(duì)生物信息分析的基本方法和技能的掌握程度和對(duì)結(jié)果的分析解釋能力 。因此,在生物信息學(xué)考試中嘗試引入實(shí)踐技能考試,重點(diǎn)考核學(xué)生知識(shí)應(yīng)用能力。實(shí)踐技 能考試采用無(wú)紙化考試方式,學(xué)生在互聯(lián)網(wǎng)環(huán)境下,對(duì)序列進(jìn)行生物信息分析并對(duì)結(jié)果進(jìn)行 解釋,不僅考核學(xué)生對(duì)基本知識(shí)和基本原理的掌握,而且考查學(xué)生進(jìn)行生物信息分析的實(shí)際 能力和分析思考能力。通過(guò)實(shí)踐技能考試,淡化理論考試,克服傳統(tǒng)的死記硬背,促進(jìn)學(xué)生 注重提高理論用于實(shí)踐的綜合能力,同時(shí)更有效地提高學(xué)生計(jì)算機(jī)應(yīng)用能力。除采用實(shí)踐技 能考試并將其作為學(xué)生成績(jī)的主要部分外,還加強(qiáng)了對(duì)學(xué)生平時(shí)學(xué)習(xí)態(tài)度、學(xué)習(xí)能力、創(chuàng)新 思維等方面的考核。
總之,生物信息學(xué)教學(xué)是網(wǎng)絡(luò)環(huán)境下生物教學(xué)的全新內(nèi)容。通過(guò)上述教學(xué)措施,提高了學(xué)生 的 學(xué)習(xí)積極性、實(shí)踐操作能力、解決實(shí)際問(wèn)題的綜合應(yīng)用能力及創(chuàng)新能力,收到了良好的教學(xué) 效果,得到了學(xué)生的普遍歡迎,具有較強(qiáng)的可操作性和實(shí)踐性。在今后的教學(xué)實(shí)踐中,隨著 教師自身素質(zhì)的提高和進(jìn)一步的教學(xué)改革將會(huì)不斷完善生物信息學(xué)教學(xué),培養(yǎng)具有“大科學(xué) ”素質(zhì)和意識(shí)的醫(yī)學(xué)研究生人才。
參考文獻(xiàn):
篇6
任務(wù)驅(qū)動(dòng)教學(xué)法(TBL,Task-based Learning)是一種建立在建構(gòu)主義學(xué)習(xí)理論的基礎(chǔ)上,由教師根據(jù)教學(xué)要求提出“任務(wù)”,把教學(xué)內(nèi)容隱含在每一個(gè)任務(wù)中,由教師引導(dǎo)學(xué)生自己提出問(wèn)題、思考問(wèn)題、解決問(wèn)題,通過(guò)讓學(xué)生完成一個(gè)個(gè)具體的任務(wù)來(lái)調(diào)動(dòng)其學(xué)習(xí)主動(dòng)性的教學(xué)方法[1,2]。它分為如下四個(gè)基本過(guò)程:一是確定教學(xué)任務(wù),即教師分析教學(xué)目標(biāo),確定適當(dāng)?shù)慕虒W(xué)任務(wù);二是分析教學(xué)任務(wù),即教師在課堂上向?qū)W生講解教學(xué)任務(wù),使學(xué)生明確教學(xué)任務(wù)的內(nèi)容和要求,也包括講解所需要的新知識(shí);三是完成教學(xué)任務(wù),是實(shí)施教學(xué)任務(wù)的過(guò)程,也是學(xué)生發(fā)現(xiàn)問(wèn)題、解決問(wèn)題、獲取知識(shí)的過(guò)程;四是評(píng)價(jià)教學(xué)任務(wù),包括展示學(xué)生的作品、總結(jié)評(píng)比,達(dá)到鞏固知識(shí)、激勵(lì)學(xué)生的目的[3,4]。
生物信息學(xué)是當(dāng)今生命科學(xué)的前沿學(xué)科之一,它是隨上世紀(jì)末人類基因組計(jì)劃的實(shí)施而由多學(xué)科交叉發(fā)展起來(lái)的一門學(xué)科,目前已經(jīng)滲透到生命科學(xué)的各個(gè)學(xué)科。但是由于生物信息學(xué)本身的綜合性和快速發(fā)展的趨勢(shì),高校生物信息學(xué)的課程教學(xué)目前仍然處于探索階段[5]。鑒于此,我們?cè)谖以?014級(jí)、2015級(jí)生物技術(shù)本科專業(yè)生物信息學(xué)課程教學(xué)中實(shí)施了任務(wù)驅(qū)動(dòng)教學(xué)法,取得了良好的教學(xué)效果。
一、生物信息學(xué)課程教學(xué)中任務(wù)的設(shè)計(jì)
教學(xué)任務(wù)的設(shè)計(jì)是任務(wù)驅(qū)動(dòng)教學(xué)法實(shí)施的關(guān)鍵。比如在生物信息數(shù)據(jù)庫(kù)的教學(xué)時(shí),我們?cè)O(shè)計(jì)了“在NCBI/EBI/DDBJ三大數(shù)據(jù)庫(kù)中如何查找核酸蛋白序列”、“在NCBI/EBI/DDBJ三大數(shù)據(jù)庫(kù)中查找某一核酸序列的直系同源序列”等任務(wù)。在核酸序列分析的教W時(shí),我們?cè)O(shè)計(jì)了“如何確定測(cè)序獲得的某一序列是表達(dá)的基因序列”、“如何確定測(cè)序獲得的序列是新的基因序列”等教學(xué)任務(wù)。在進(jìn)化分析的教學(xué)時(shí),我們給出某一基因的序列,設(shè)計(jì)了“依據(jù)該基因的序列做出不同方法的進(jìn)化樹(shù)及分析其意義”、“依據(jù)某一基因的序列做出蛋白序列的進(jìn)化樹(shù)及分析其意義”等教學(xué)任務(wù)。在蛋白質(zhì)序列分析教學(xué)時(shí),我們?cè)O(shè)計(jì)了“根據(jù)BLAST分析來(lái)推測(cè)某一新的蛋白質(zhì)序列的可能功能”、“依據(jù)結(jié)構(gòu)域(Domain)/基元(Motif)分析某一新蛋白序列的可能功能”、“依據(jù)某一新的蛋白序列預(yù)測(cè)其二級(jí)結(jié)構(gòu)、三級(jí)結(jié)構(gòu)”等教學(xué)任務(wù)。在綜合分析的教學(xué)時(shí),我們?cè)O(shè)計(jì)了“如何尋找某一基因的啟動(dòng)子序列及可能的轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)”、“依據(jù)3種以上不同的生物信息學(xué)軟件作出某一蛋白序列及其直系同源蛋白的序列比對(duì)圖”、“如何計(jì)算幾種不同蛋白序列的相似性(Similarity)及一致性(Identity)值”等教學(xué)任務(wù)。
二、任務(wù)驅(qū)動(dòng)教學(xué)法在生物信息學(xué)課程教學(xué)中的實(shí)施
我們?cè)谖以?014級(jí)、2015級(jí)生物技術(shù)本科專業(yè)的生物信息學(xué)課程教學(xué)中實(shí)施了任務(wù)驅(qū)動(dòng)教學(xué)法。任務(wù)驅(qū)動(dòng)教學(xué)法的實(shí)施全程在機(jī)房進(jìn)行,機(jī)房?jī)?nèi)配置了高速上網(wǎng)的網(wǎng)絡(luò)和常用的生物信息學(xué)分析軟件。在教學(xué)前的準(zhǔn)備階段,需要根據(jù)上課的班級(jí)組建好不同的小組,同學(xué)們也先行修習(xí)過(guò)相關(guān)的理論課程,然后將設(shè)計(jì)好的一系列教學(xué)任務(wù)分發(fā)到不同小組的同學(xué)中,同時(shí)建議同學(xué)們查找一些相關(guān)的分析方法和資料;在課堂教學(xué)階段,上課后教師會(huì)分析教學(xué)任務(wù),任課教師也根據(jù)以前的教學(xué)內(nèi)容給出一些線索,然后在不同的小組內(nèi)進(jìn)行討論,最后根據(jù)不同的討論結(jié)果讓不同小組的同學(xué)在給出的時(shí)間內(nèi)完成設(shè)計(jì)的教學(xué)任務(wù)。對(duì)于不同小組在完成教學(xué)任務(wù)過(guò)程中遇到的問(wèn)題,教師需要適度地解釋和引導(dǎo),而不是完全地幫助解決和完成教學(xué)任務(wù)。在整個(gè)的教學(xué)過(guò)程中,要循序漸進(jìn),爭(zhēng)取達(dá)到最好的教學(xué)效果。在教學(xué)任務(wù)初步完成后,教師要根據(jù)不同小組教學(xué)任務(wù)的完成情況,給予分析、點(diǎn)評(píng)和總結(jié)。上課的同學(xué)都希望自己完成任務(wù)的思路和線索得到肯定,對(duì)于完成教學(xué)任務(wù)較好的同學(xué)要給予正面的表?yè)P(yáng),對(duì)于完成教學(xué)任務(wù)不太好的同學(xué)也要給予鼓勵(lì)和關(guān)注,直到這部分同學(xué)也能獨(dú)立、完整地完成全部的教學(xué)任務(wù)。
三、任務(wù)驅(qū)動(dòng)教學(xué)法在生物信息學(xué)課程教學(xué)中的效果
為評(píng)價(jià)教學(xué)效果,我們對(duì)于實(shí)施任務(wù)驅(qū)動(dòng)教學(xué)法和對(duì)照組的同學(xué)對(duì)于教學(xué)的滿意度、學(xué)生的考試成績(jī)等問(wèn)題進(jìn)行了問(wèn)卷調(diào)查,并對(duì)調(diào)查結(jié)果進(jìn)行了數(shù)據(jù)分析。同時(shí),我們也對(duì)承擔(dān)生物信息學(xué)課程教學(xué)任務(wù)的任課教師對(duì)于該課程的學(xué)習(xí)情況等進(jìn)行了問(wèn)卷調(diào)查和數(shù)據(jù)分析。根據(jù)調(diào)查結(jié)果,95%以上的同學(xué)認(rèn)可任務(wù)驅(qū)動(dòng)教學(xué)法在生物信息學(xué)課程教學(xué)中的實(shí)施,普遍認(rèn)為任務(wù)驅(qū)動(dòng)教學(xué)法在該課程中的實(shí)施能夠顯著提高學(xué)生學(xué)習(xí)的興趣、團(tuán)隊(duì)協(xié)作精神的培養(yǎng)和對(duì)于理論知識(shí)的掌握。從考試的成績(jī)來(lái)看,實(shí)施任務(wù)驅(qū)動(dòng)教學(xué)法的同學(xué)考試綜合成績(jī)優(yōu)良率(80分以上)達(dá)到50%以上,顯著高于傳統(tǒng)教學(xué)法同學(xué)成績(jī)的優(yōu)良率(30%左右)。從教師評(píng)學(xué)的情況看,任課教師普遍認(rèn)為任務(wù)驅(qū)動(dòng)教學(xué)法在生物信息學(xué)課程教學(xué)中的實(shí)施對(duì)于提高學(xué)生學(xué)習(xí)興趣、增強(qiáng)學(xué)生的創(chuàng)新能力和掌握教學(xué)知識(shí)點(diǎn)等方面均顯著高于實(shí)施傳統(tǒng)教學(xué)法的對(duì)照組同學(xué)。這一結(jié)果表明,在實(shí)踐性很強(qiáng)的生物信息學(xué)課程中實(shí)施任務(wù)驅(qū)動(dòng)教學(xué)法相對(duì)于傳統(tǒng)的教學(xué)模式具有明顯的優(yōu)勢(shì)。
四、完善任務(wù)驅(qū)動(dòng)教學(xué)法在生物信息學(xué)課程教學(xué)中應(yīng)用的思考
生物信息學(xué)是一門以研究生物序列為主的實(shí)踐性非常強(qiáng)的課程,具有教學(xué)知識(shí)點(diǎn)非常多、熟練掌握課程知識(shí)點(diǎn)相對(duì)較難等特點(diǎn)。我們?cè)谖以罕究粕镄畔W(xué)課程中實(shí)施了任務(wù)驅(qū)動(dòng)教學(xué)法,總體教學(xué)效果較好,同時(shí)我們也發(fā)現(xiàn)了任務(wù)驅(qū)動(dòng)教學(xué)法在該課程教學(xué)中一些值得注意的問(wèn)題。一是針對(duì)不同學(xué)生的特點(diǎn),任務(wù)的設(shè)計(jì)要難度適宜,要有不同層次、不同難度任務(wù)的設(shè)計(jì)。在教學(xué)過(guò)程中,要適當(dāng)精簡(jiǎn)教學(xué)內(nèi)容,加強(qiáng)常用軟件和程序的使用和練習(xí);二是課程教學(xué)需要在電腦機(jī)房實(shí)施,需要較好的計(jì)算機(jī)配置和較高的網(wǎng)絡(luò)連接速度,對(duì)學(xué)時(shí)的要求要更連貫,同時(shí)要鼓勵(lì)學(xué)生在課后使用自己的計(jì)算機(jī)進(jìn)一步練習(xí)和實(shí)踐;三是在教學(xué)過(guò)程中要有更多的引導(dǎo)和示范,進(jìn)行實(shí)例教學(xué);四是在教學(xué)過(guò)程中需要小組內(nèi)同學(xué)間更多的討論和協(xié)商;五是對(duì)授課教師的專業(yè)知識(shí)和能力有更高的要求。生物信息學(xué)的課程教學(xué)實(shí)踐性非常強(qiáng),知識(shí)的更新也非??欤瑢?shí)施任務(wù)驅(qū)動(dòng)教學(xué)法對(duì)于任課教師的專業(yè)知識(shí)和能力提出了更高的要求。為達(dá)到較好的教學(xué)效果,需要引進(jìn)高水平的師資隊(duì)伍,同時(shí)對(duì)已有的青年教師也要派出到高水平大學(xué)學(xué)習(xí)和培訓(xùn)。同時(shí),在生物信息學(xué)課程中實(shí)施任務(wù)驅(qū)動(dòng)法的教學(xué),最好由兩名以上專業(yè)教師同時(shí)實(shí)施教學(xué)。總之,任務(wù)驅(qū)動(dòng)教學(xué)法在生物信息學(xué)課程中的應(yīng)用既顯示了較明顯的成效,也還需要進(jìn)一步的研究和實(shí)踐。
⒖嘉南祝
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篇7
歷史――國(guó)內(nèi)醫(yī)學(xué)信息學(xué)演變自醫(yī)學(xué)情報(bào)學(xué)
醫(yī)學(xué)信息學(xué)發(fā)展的標(biāo)志可追溯到國(guó)際信息處理聯(lián)合會(huì)(Internationl Federation for Information Processing,IFTP)在1967年成立的與衛(wèi)生有關(guān)的技術(shù)委員會(huì)。經(jīng)過(guò)不斷發(fā)展,于1978年成立了國(guó)際醫(yī)學(xué)信息學(xué)會(huì)(Internationl Medical Informatics Assciation,IMIA)。IMIA是國(guó)際醫(yī)學(xué)信息學(xué)領(lǐng)域內(nèi)的權(quán)威組織,為醫(yī)學(xué)信息學(xué)學(xué)科建設(shè)、醫(yī)療行業(yè)信息化做出了貢獻(xiàn)。
我國(guó)的醫(yī)學(xué)信息學(xué)教育與醫(yī)學(xué)圖書館學(xué)、情報(bào)學(xué)以及信息管理學(xué)密不可分,醫(yī)學(xué)信息教育的起源和孕育是在20世紀(jì)60年代以后,那時(shí)多所醫(yī)學(xué)院校根據(jù)醫(yī)院和社會(huì)需求設(shè)置了醫(yī)學(xué)圖書館專業(yè)的在職培訓(xùn)。到了80年代初,由于醫(yī)學(xué)圖書館對(duì)專業(yè)人才的實(shí)際需求已經(jīng)很大,在對(duì)前期醫(yī)學(xué)圖書館類教育實(shí)踐進(jìn)行充分論證后,經(jīng)衛(wèi)生部批準(zhǔn),在原白求恩醫(yī)科大學(xué)、同濟(jì)醫(yī)科大學(xué)、中國(guó)醫(yī)科大學(xué)和湖南醫(yī)科大學(xué)設(shè)置“醫(yī)學(xué)圖書館情報(bào)專業(yè)”,四年制本科,畢業(yè)授予醫(yī)學(xué)學(xué)位。
醫(yī)學(xué)情報(bào)學(xué)發(fā)展到20世紀(jì)90年代,隨著信息手段不斷在各個(gè)行業(yè)中應(yīng)用發(fā)展,一些醫(yī)學(xué)高校便逐漸將圖書館學(xué)系更名為信息管理系,并開(kāi)設(shè)了“醫(yī)學(xué)信息學(xué)”方向的專業(yè),當(dāng)時(shí)也有些醫(yī)院建立了單機(jī)的醫(yī)療管理系統(tǒng)。根據(jù)1993年7月16日原國(guó)家教委頒布的《普通高等學(xué)校本科專業(yè)目錄》,醫(yī)學(xué)圖書情報(bào)學(xué)專業(yè)也進(jìn)行了名稱上的調(diào)整,專業(yè)名稱由“醫(yī)學(xué)情報(bào)學(xué)(醫(yī)學(xué)、藥學(xué))”改為“信息學(xué)(醫(yī)學(xué)、藥學(xué))”,拓寬了專業(yè)口徑。這為我國(guó)醫(yī)學(xué)信息學(xué)教育走上正規(guī)化與專業(yè)化打下了基礎(chǔ),其意義也是不言而喻的。
1998年7月,教育部重新頒布了《普通高等學(xué)校本科專業(yè)目錄》,對(duì)原專業(yè)目錄做出了新的調(diào)整,將若干相近專業(yè)進(jìn)行了合并和重組,將原來(lái)“經(jīng)濟(jì)信息管理”、“信息學(xué)”、“科技信息”和“管理信息系統(tǒng)”等5個(gè)專業(yè)合并為“信息管理和信息系統(tǒng)”,隸屬管理學(xué)門類。于是各醫(yī)學(xué)高校在此基礎(chǔ)上將“醫(yī)藥/衛(wèi)生信息管理專業(yè)方向”設(shè)在信息管理和信息系統(tǒng)專業(yè)之下,重新調(diào)整了培養(yǎng)方案和課程設(shè)置。
到了2002年底,經(jīng)教育部批準(zhǔn),中南大學(xué)將“信息管理和信息系統(tǒng)(醫(yī)學(xué)方向)”專業(yè)更名為“醫(yī)學(xué)信息學(xué)”專業(yè),專業(yè)代碼070408W。2003年秋開(kāi)始首次以“醫(yī)學(xué)信息學(xué)”專業(yè)對(duì)外招生,這標(biāo)志著中國(guó)醫(yī)學(xué)信息學(xué)專業(yè)的正式起步。與此同時(shí),南通大學(xué)與南通醫(yī)學(xué)院合并,開(kāi)始正式招收“醫(yī)學(xué)信息學(xué)”專業(yè)本科生,醫(yī)學(xué)信息學(xué)教育在我國(guó)逐漸發(fā)展起來(lái)。
現(xiàn)狀――醫(yī)學(xué)信息學(xué)教育在我國(guó)的發(fā)展
專業(yè)調(diào)整以及培養(yǎng)方向多樣化后,醫(yī)學(xué)信息學(xué)教育已經(jīng)成為國(guó)家醫(yī)學(xué)教育和信息管理教育體系中的一部分。2000年以后,隨著醫(yī)藥科學(xué)的發(fā)展以及隨之而來(lái)的醫(yī)改大潮,對(duì)醫(yī)學(xué)信息學(xué)人才提出了更高更專業(yè)的要求,學(xué)科發(fā)展浪潮的強(qiáng)烈沖擊已經(jīng)開(kāi)始了。
放眼國(guó)際,醫(yī)學(xué)信息學(xué)的學(xué)科發(fā)展和培養(yǎng)方向逐漸達(dá)成了相對(duì)的共識(shí)?!霸趪?guó)內(nèi),雖然醫(yī)學(xué)信息學(xué)這個(gè)名詞相對(duì)還很新鮮,但我們的產(chǎn)業(yè)已經(jīng)發(fā)展在前了,各個(gè)醫(yī)院已經(jīng)使用了多種信息系統(tǒng)。但在學(xué)術(shù)領(lǐng)域上來(lái)講,還有很多人并不理解醫(yī)學(xué)信息學(xué)到底是什么,還帶有太多的醫(yī)學(xué)情報(bào)學(xué)的烙印。”北京大學(xué)醫(yī)學(xué)信息學(xué)中心常務(wù)副主任雷健波說(shuō)。“現(xiàn)在,國(guó)際公認(rèn)的醫(yī)學(xué)信息學(xué)學(xué)科體系可分為如下幾個(gè)相互關(guān)聯(lián)的領(lǐng)域――生物信息學(xué)、圖像信息學(xué)、臨床信息學(xué)、公共衛(wèi)生信息學(xué)。這其中到底有什么區(qū)別,是我們?cè)谝院蟮娜瞬排囵B(yǎng)中必須要弄明確的?!?/p>
當(dāng)然,醫(yī)學(xué)信息學(xué)在國(guó)外發(fā)展了30年后,國(guó)內(nèi)醫(yī)學(xué)信息教育事業(yè)也并沒(méi)有原地踏步。我們非常高興地看到,在2000~2009年期間,經(jīng)過(guò)教育部備案或批準(zhǔn)設(shè)置面向醫(yī)藥衛(wèi)生領(lǐng)域的信息管理與信息系統(tǒng)專業(yè)和醫(yī)學(xué)信息學(xué)專業(yè)的高等院校已經(jīng)從20世紀(jì)80年代的4所增加到當(dāng)今的40多所,國(guó)內(nèi)醫(yī)學(xué)信息學(xué)教育格局發(fā)生了根本性的變化,開(kāi)始了前所未有的新局面。
研究――符合我國(guó)國(guó)情的學(xué)科研究?jī)?nèi)容
新醫(yī)改將醫(yī)學(xué)信息學(xué)的發(fā)展提上了一個(gè)新的日程,中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院醫(yī)學(xué)信息研究所所長(zhǎng)代濤認(rèn)為,我國(guó)醫(yī)學(xué)信息學(xué)的研究領(lǐng)域體現(xiàn)在以下幾個(gè)方面。
1. 醫(yī)學(xué)知識(shí)表達(dá)
即通過(guò)收集醫(yī)學(xué)相關(guān)知識(shí),對(duì)其進(jìn)行系統(tǒng)和正式的定義;保證人和計(jì)算機(jī)對(duì)醫(yī)學(xué)知識(shí)的一致性理解。如醫(yī)學(xué)知識(shí)組織體系,分類表、主題表、醫(yī)學(xué)分類、醫(yī)學(xué)本體、一體化語(yǔ)言系統(tǒng)等。醫(yī)學(xué)知識(shí)組織體系的研究是我們開(kāi)展醫(yī)學(xué)信息學(xué)研究的基礎(chǔ)。同時(shí),還有醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)編碼與標(biāo)準(zhǔn)、醫(yī)學(xué)信息檢索、醫(yī)學(xué)決策支持。
2. 衛(wèi)生信息系統(tǒng)
在我國(guó),利用衛(wèi)生信息系統(tǒng)來(lái)改善衛(wèi)生保健的質(zhì)量,降低醫(yī)療成本,成為醫(yī)療衛(wèi)生服務(wù)信息系統(tǒng)的一個(gè)主要內(nèi)容,從而建立一個(gè)像美國(guó)一樣的龐大的醫(yī)療體系。這個(gè)系統(tǒng)有醫(yī)院信息系統(tǒng)、成像系統(tǒng)、電子病歷、健康檔案、區(qū)域衛(wèi)生信息系統(tǒng)、遠(yuǎn)程醫(yī)療等。
3. 生物信息學(xué)
生物信息學(xué)(BioInformatics)是自人類基因組計(jì)劃以來(lái),人類與模式生物基因組的測(cè)試工作產(chǎn)生了大量數(shù)據(jù),基于此情況而產(chǎn)生的,是研究、開(kāi)發(fā)或應(yīng)用計(jì)算機(jī)工具和方法來(lái)擴(kuò)展對(duì)生物學(xué)、醫(yī)學(xué)、行為科學(xué)和衛(wèi)生數(shù)據(jù)的使用,包括獲取、存儲(chǔ)、組織、分析和可視化這些數(shù)據(jù)。
篇8
表位是抗原分子中被相應(yīng)抗體或抗原受體識(shí)別的特定部位。B細(xì)胞表位[1]是抗原中可被B細(xì)胞抗原受體(BCR)或抗體特異性識(shí)別并結(jié)合的線性片段或空間構(gòu)象性結(jié)構(gòu),其刺激機(jī)體產(chǎn)生B細(xì)胞介導(dǎo)的體液免疫應(yīng)答,并產(chǎn)生效應(yīng)分子(抗體)和效應(yīng)細(xì)胞。線性B細(xì)胞表位是由抗原分子表面肽鏈上連續(xù)的氨基酸殘基構(gòu)成的序列。B細(xì)胞表位預(yù)測(cè)研究主要還是以線性B細(xì)胞表位預(yù)測(cè)為主,目前已有較多關(guān)于線性B細(xì)胞表位的數(shù)據(jù)庫(kù)和預(yù)測(cè)算法、軟件。
1 抗原表位
抗原表位[2],又稱抗原決定簇(antigenic determinant,AD)指抗原分子中決定抗原特異性的特殊化學(xué)基團(tuán)??乖ㄟ^(guò)抗原表位與相應(yīng)的淋巴細(xì)胞表面的抗原受體結(jié)合,從而激活淋巴細(xì)胞,引起免疫應(yīng)答;抗原也借表位與相應(yīng)抗體或致敏淋巴細(xì)胞發(fā)生特異性結(jié)合而發(fā)揮免疫效應(yīng)??乖砦坏男再|(zhì)、數(shù)目和空間構(gòu)型決定抗原的特異性??乖砦皇敲庖咴乖缘奈镔|(zhì)基礎(chǔ),開(kāi)展對(duì)抗原表位的研究將對(duì)病原的診斷以及分子疫苗的設(shè)計(jì)等具有重要的意義。
2 線性B細(xì)胞表位篩選方法
B細(xì)胞表位[3]是抗原中可被B細(xì)胞抗原受體(BCR)或抗體特異性識(shí)別并結(jié)合的線性片段或空間構(gòu)象性結(jié)構(gòu),其刺激機(jī)體產(chǎn)生B細(xì)胞介導(dǎo)的體液免疫應(yīng)答,并產(chǎn)生效應(yīng)分子(抗體)和效應(yīng)細(xì)胞。在免疫學(xué)中認(rèn)為,表位才是抗原刺激機(jī)體免疫系統(tǒng)產(chǎn)生特異性免疫應(yīng)答的真正部位。B細(xì)胞表位預(yù)測(cè)是表位預(yù)測(cè)的一個(gè)重要組成部分,大多數(shù)的研究是針對(duì)線性B細(xì)胞表位預(yù)測(cè),通過(guò)組合抗原蛋白物理化學(xué)性質(zhì)、結(jié)構(gòu)性質(zhì)、統(tǒng)計(jì)顯著性度量等特征屬性進(jìn)行表位預(yù)測(cè),并取得一定的研究成果。
2.1 基于遞歸神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的線性B細(xì)胞表位預(yù)測(cè)服務(wù)器[4]
在多肽疫苗的開(kāi)發(fā)中B細(xì)胞表位起到了至關(guān)重要的作用,在疾病的診斷中,也可用于過(guò)敏研究。標(biāo)準(zhǔn)的前饋(FNN)和遞歸神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(RNN)有被用在本研究中,用于預(yù)測(cè)抗原序列中的B細(xì)胞表位。網(wǎng)絡(luò)已經(jīng)被訓(xùn)練和測(cè)試,在一個(gè)完整的數(shù)據(jù)集中,由700個(gè)非冗余的B細(xì)胞表位來(lái)自于Bcipep數(shù)據(jù)庫(kù)和同等數(shù)量的非表位來(lái)自于SWISS-PROT數(shù)據(jù)庫(kù)。該網(wǎng)絡(luò)已經(jīng)訓(xùn)練和測(cè)試在不同的輸入窗口長(zhǎng)度和隱結(jié)點(diǎn)中。最大精度已使用遞歸神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)具有單隱層的35個(gè)隱藏的單位窗口長(zhǎng)度為16。當(dāng)測(cè)試在五倍折交叉驗(yàn)證時(shí),最終的網(wǎng)絡(luò)產(chǎn)生準(zhǔn)確度為65.93%。相應(yīng)的敏感性,特異性和陽(yáng)性預(yù)測(cè)值為67.14,64.71,和65.61%。在以往的研究中RNN比FNN在B細(xì)胞表位的預(yù)測(cè)中效果更好。該肽的長(zhǎng)度也是重要的在預(yù)用詞從抗原序列的B細(xì)胞表位。
2.2 基于氨基酸對(duì)抗原規(guī)模的線性B細(xì)胞表位預(yù)測(cè)[5]
在生物信息學(xué)中蛋白抗原位點(diǎn)的鑒定是至關(guān)重要的,開(kāi)發(fā)的合成肽疫苗,免疫診斷測(cè)試的距離和抗體的產(chǎn)生。目前,大多數(shù)的預(yù)測(cè)算法傾向于使用氨基酸滑動(dòng)窗口方法。這些方法過(guò)于簡(jiǎn)單,并在實(shí)踐中產(chǎn)生不良的預(yù)測(cè)結(jié)果。提出了一種新穎的規(guī)模,稱為氨基酸對(duì)抗原(AAP)規(guī)模,基于這一發(fā)現(xiàn),更加有利于B細(xì)胞表位預(yù)測(cè)。它表明,使用SVM(支持向量機(jī))分類,AAP抗原尺度方法具有更好的性能比現(xiàn)有單個(gè)氨基酸傾向尺度。AAP抗原規(guī)??梢苑从骋恍┨厥獾男蛄性贐細(xì)胞表位特征中,它的本質(zhì)是為什么新的方法是優(yōu)于現(xiàn)有的??梢灶A(yù)料與已知的抗原表位的數(shù)據(jù),氨基酸對(duì)抗原規(guī)模的做法將進(jìn)一步增強(qiáng)。
2.3 基于內(nèi)核字符串線性B細(xì)胞表位預(yù)測(cè)[6]
B細(xì)胞表位的鑒定和表征在疫苗設(shè)計(jì)中扮演重要的角色,免疫診斷測(cè)試,并產(chǎn)生抗體。因此,可靠的計(jì)算工具預(yù)測(cè)線性B細(xì)胞表位是非常可取的。評(píng)估的支持向量機(jī)(SVM)利用五個(gè)不同的內(nèi)核上五倍使用交叉驗(yàn)證的方法分類培訓(xùn)同源減少701線性B細(xì)胞表位,從Bcipep數(shù)據(jù)庫(kù)中提取的數(shù)據(jù),和701非抗原表位,隨機(jī)抽取從SwissProt數(shù)據(jù)庫(kù)序列。根據(jù)我們的結(jié)果計(jì)算實(shí)驗(yàn)中,我們提出BCPred,線性B細(xì)胞表位預(yù)測(cè)的新方法使用序列內(nèi)核。我們表明,預(yù)測(cè)性能BCPred(AUC=0.758)優(yōu)于11基于SVM分類器的開(kāi)發(fā)和評(píng)估,以及在我們的實(shí)驗(yàn)中,我們執(zhí)行的AAP(AUC=0.7),最近提出的一種方法,用于預(yù)測(cè)線性B細(xì)胞使用氨基酸對(duì)抗原的表位。此外,我們比較AAP和BCPred,ABCPred 獨(dú)特的B細(xì)胞表位,使用遞歸神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的方法,該方法為使用兩個(gè)數(shù)據(jù)集先前已用于評(píng)估ABCPred的。使用和分析的數(shù)據(jù)集的結(jié)果這個(gè)比較表明,不同的B細(xì)胞表位的相對(duì)性能的結(jié)論預(yù)測(cè)方法的基礎(chǔ)上得出的實(shí)驗(yàn)中使用的數(shù)據(jù)集的獨(dú)特的B細(xì)胞表位的可能產(chǎn)生的性能評(píng)估方法的估計(jì)過(guò)于樂(lè)觀。這認(rèn)為使用精心同源性減小數(shù)據(jù)集的B細(xì)胞表位的預(yù)測(cè)方法進(jìn)行比較,以避免有關(guān)如何不同的方法的誤導(dǎo)性的結(jié)論相互比較。同源精簡(jiǎn)數(shù)據(jù)組和BCPred實(shí)現(xiàn)以及APP的方法是公開(kāi)的。
2.4 基于一種新系統(tǒng)的線性B細(xì)胞表位預(yù)測(cè)[7]
在幾十年的研究中盡管具有挑戰(zhàn)性的任務(wù),B細(xì)胞抗原表位的準(zhǔn)確的預(yù)測(cè)仍然是在計(jì)算免疫學(xué)中。只有10%的已知B細(xì)胞表位的估計(jì)是連續(xù)的,但他們往往卻是目標(biāo)預(yù)測(cè),因?yàn)榻鉀Q三級(jí)結(jié)構(gòu)是必需的,它們是不可或缺的肽疫苗和治療蛋白質(zhì)工程的發(fā)展。在這篇文章中,提出COBEpro,新的兩步預(yù)測(cè)連續(xù)B細(xì)胞系統(tǒng)抗原表位。COBEpro是能夠分配表位pensity分?jǐn)?shù)兩個(gè)獨(dú)立的肽片段抗原序列內(nèi)的殘留物。COBEpro首先使用支持向量機(jī)進(jìn)行預(yù)測(cè)在查詢抗原序列和肽片段,然后計(jì)算表位的傾向得分為每個(gè)基于片段的預(yù)測(cè)的殘余物。次要結(jié)構(gòu)和溶劑輔助功能信息(無(wú)論是預(yù)測(cè)或準(zhǔn)確)可以被納入到提高性能。COBEpro實(shí)現(xiàn)了交叉驗(yàn)證受試者工作特征曲線(AUC)下teristic高達(dá)0.829片段上抗原決定基的傾向得分任務(wù)的AUC為0.628殘余物外延主題傾向得分任務(wù)。
3 用于線性B細(xì)胞表位預(yù)測(cè)工具建立與評(píng)價(jià)的數(shù)據(jù)庫(kù)
免疫信息學(xué)[8]數(shù)據(jù)庫(kù)是隨著生物信息學(xué)和免疫基因組學(xué)的不斷進(jìn)步而逐漸發(fā)展起來(lái)的,是專門收錄免疫學(xué)相關(guān)分子信息,實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)存儲(chǔ)、查詢、分析,計(jì)算等功能的數(shù)據(jù)庫(kù)。最初,與免疫相關(guān)的多肽序列、抗原分子等信息與其他生物數(shù)據(jù)一起,被收錄在各類生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)中,隨著免疫學(xué)研究的發(fā)展,人們對(duì)免疫學(xué)相關(guān)分子信息的需求越來(lái)越迫切,需要單獨(dú)對(duì)這些數(shù)據(jù)進(jìn)行計(jì)算、分析和預(yù)測(cè),一些研究機(jī)構(gòu)開(kāi)始嘗試從生物信息學(xué)基礎(chǔ)數(shù)據(jù)庫(kù)中提取免疫相關(guān)的生物數(shù)據(jù),開(kāi)發(fā)集存儲(chǔ)、查詢、計(jì)算、預(yù)測(cè)以及繪圖分析功能為一體的免疫學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)。目前,網(wǎng)絡(luò)上的免疫信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)已達(dá)數(shù)十個(gè),它們的規(guī)模大小不一,內(nèi)容與側(cè)重點(diǎn)也不盡相同,其中的大部分?jǐn)?shù)據(jù)來(lái)源于GenBank、EBI、EMBL,供研究人員免費(fèi)使用。
3.1 Bcipep:B細(xì)胞表位數(shù)據(jù)庫(kù)
Bcipep[9]是各種免疫原性B細(xì)胞表位數(shù)據(jù)庫(kù),目前Bcipep數(shù)據(jù)庫(kù)包含3031個(gè)條目,其中包括763免疫顯性,1797免疫原性和471空的免疫原性的抗原表位,每條記錄包含多肽序列、源蛋白、病原體、免疫原性、中和性、模式生物、實(shí)驗(yàn)方法、參考文獻(xiàn)、抗原結(jié)構(gòu)等信息,它涵蓋范圍廣泛,如病毒、細(xì)菌、原生動(dòng)物、真菌。該數(shù)據(jù)庫(kù)提供了一組工具,用于分析和提取的數(shù)據(jù),其中包括關(guān)鍵字搜索,肽譜分析和BLAST搜索。Bcipep稱為一個(gè)完整B細(xì)胞表位數(shù)據(jù)庫(kù),已經(jīng)開(kāi)發(fā)了一個(gè)覆蓋廣泛的病原體的抗原決定簇的信息。該數(shù)據(jù)庫(kù)有助于B細(xì)胞表位預(yù)測(cè)方法的研究、合成肽疫苗的設(shè)計(jì)和疾病的診斷。
4 結(jié)束語(yǔ)
顯而易見(jiàn),線性B細(xì)胞表位預(yù)測(cè)現(xiàn)狀與人們理想預(yù)期還存在很大的差距,利用軟件預(yù)測(cè)線性B細(xì)胞表位并不完全準(zhǔn)確,還需要實(shí)驗(yàn)的進(jìn)一步驗(yàn)證。為了研發(fā)更準(zhǔn)確的預(yù)測(cè)工具,需要建立高質(zhì)量的訓(xùn)練數(shù)據(jù)集和檢驗(yàn)數(shù)據(jù)集,數(shù)據(jù)集的質(zhì)量高低與預(yù)測(cè)工具的預(yù)測(cè)能力密切聯(lián)系;另外,統(tǒng)一評(píng)價(jià)體系也是目前急待解決的問(wèn)題。評(píng)價(jià)體系的標(biāo)準(zhǔn)化,既有助于軟件開(kāi)發(fā)者采用最有效的算法創(chuàng)建更準(zhǔn)確的工具,又方便了使用者對(duì)工具的篩選和評(píng)價(jià)。統(tǒng)一評(píng)價(jià)體系首先要面臨的問(wèn)題是所有數(shù)據(jù)格式的統(tǒng)一,有了一致的數(shù)據(jù)格式,才能進(jìn)行比較。在表位預(yù)測(cè)領(lǐng)域尚缺乏高質(zhì)量的標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)集,針對(duì)標(biāo)準(zhǔn)的數(shù)據(jù)集開(kāi)發(fā)自動(dòng)評(píng)價(jià)工具將是未來(lái)的發(fā)展方向。相信隨著生物信息學(xué)的快速發(fā)展,線性B細(xì)胞表位計(jì)算機(jī)預(yù)測(cè)技術(shù)將會(huì)越來(lái)越成熟。
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篇9
大眾媒體在世界范圍內(nèi)經(jīng)歷了網(wǎng)絡(luò)化的歷程,網(wǎng)絡(luò)從過(guò)去的2G、3G到現(xiàn)代4G,從過(guò)去的有線上網(wǎng)到現(xiàn)代的無(wú)線上網(wǎng),信息化、數(shù)字化和網(wǎng)絡(luò)化的高度一體化的信息交流方式使人們明顯感覺(jué)到這種新的方式帶給我們的快捷與自由,開(kāi)放與互動(dòng);但網(wǎng)絡(luò)技術(shù)帶給我們的種種優(yōu)勢(shì)的同時(shí)也讓一些人違背了理性,利用網(wǎng)絡(luò)技術(shù)牟取暴利,超越了法制的界限而給社會(huì)和個(gè)人帶來(lái)極大危害。網(wǎng)絡(luò)技術(shù)健康發(fā)展需要采取經(jīng)濟(jì)、社會(huì)、法律、倫理、文化等多種手段,比如改革不合理的國(guó)際政治經(jīng)濟(jì)秩序,建構(gòu)具有適應(yīng)性和靈活性的網(wǎng)絡(luò)社會(huì)結(jié)構(gòu),發(fā)展具有人性化的新技術(shù),建構(gòu)和完善網(wǎng)絡(luò)法律法規(guī),建構(gòu)具有現(xiàn)代網(wǎng)絡(luò)精神的網(wǎng)絡(luò)倫理,培養(yǎng)健康、全面的網(wǎng)絡(luò)人格,等等。技術(shù)的進(jìn)步給了人們以更大的信息支配能力,也要求人們更嚴(yán)格地控制自己的行為。要建立一個(gè)干凈的互聯(lián)網(wǎng)絡(luò),需要法律和技術(shù)上的不斷完善,也需要網(wǎng)絡(luò)中的每個(gè)人的自律和自重。因此,網(wǎng)絡(luò)的未來(lái)應(yīng)朝著個(gè)人與社會(huì),個(gè)體與群體,個(gè)性與共性之間分散而有張力的互動(dòng)形態(tài)發(fā)展,從而實(shí)現(xiàn)個(gè)人自由發(fā)展與社會(huì)共合體健康發(fā)展的雙重目標(biāo)。同樣,在大學(xué)校園內(nèi),對(duì)學(xué)生而言網(wǎng)絡(luò)所起的作用也有兩面性。網(wǎng)絡(luò)的好處是它能夠促使大學(xué)成了一個(gè)開(kāi)放的校外園,順利地聯(lián)系外面的世界及了解自己感興趣的事物。而網(wǎng)絡(luò)也會(huì)使某些學(xué)生認(rèn)為知識(shí)都能夠在網(wǎng)絡(luò)中尋找到,到使用時(shí),只要上網(wǎng)查找就行了,讀書無(wú)用,浪費(fèi)時(shí)間,所以他們將美好光陰浪費(fèi)于網(wǎng)絡(luò)游戲世界,內(nèi)心變得無(wú)比空虛。
網(wǎng)絡(luò)環(huán)境是一個(gè)現(xiàn)實(shí),我們無(wú)法拒絕它。但我們普通大學(xué)生應(yīng)該如何適應(yīng)它,利用它自主地學(xué)習(xí),而不沉迷網(wǎng)絡(luò)游戲呢?作為教師,如何引領(lǐng)大學(xué)生走進(jìn)現(xiàn)代化的網(wǎng)絡(luò)世界,提高學(xué)習(xí)效率,是體現(xiàn)教學(xué)能力的不可回避的話題。結(jié)合教學(xué)改革,我們進(jìn)行了一次成功的嘗試,即在網(wǎng)絡(luò)環(huán)境下,學(xué)生自主學(xué)習(xí)拓寬生物學(xué)知識(shí)的教學(xué)案例,現(xiàn)總結(jié)如下。
案例:
我們從英國(guó)生工網(wǎng)站(Http://sanger.ac.uk)獲得了一款英文版的生物信息學(xué)軟件Artemis,該軟件主要是將細(xì)菌基因組序列進(jìn)行比對(duì)并進(jìn)行差異化圖示,為進(jìn)一步研究細(xì)菌基因組生物信息學(xué)奠定基礎(chǔ)。破譯并應(yīng)用此款軟件,需要具備一定的英語(yǔ)翻譯能力、電腦網(wǎng)絡(luò)的應(yīng)用能力,以及興趣及持之以恒的能力。由于本人對(duì)電腦網(wǎng)絡(luò)知識(shí)的缺乏,此款軟件的作用沒(méi)有得到應(yīng)有的發(fā)揮。生物科學(xué)與技術(shù)學(xué)院生工1101班本科學(xué)生閆競(jìng)直同學(xué),主動(dòng)聯(lián)系了我。他具有電腦相關(guān)知識(shí)、英語(yǔ)及對(duì)生物學(xué)軟件興趣的優(yōu)勢(shì),承擔(dān)對(duì)該軟件的說(shuō)明書的翻譯工作,并對(duì)該軟件的使用程序進(jìn)行破譯,還將該軟件的應(yīng)用傳授給其他學(xué)生,使其他學(xué)生,甚至研究生也能從中受益,幫助他們解決研究中遇到的實(shí)際問(wèn)題。他的這一行為大受歡迎并得到廣泛贊許。
總結(jié)與體會(huì):
1.生物信息學(xué)知識(shí)學(xué)習(xí)和拓展,進(jìn)一步提高了學(xué)生對(duì)生物學(xué)的興趣。興趣是最好的老師,興趣可以引導(dǎo)學(xué)生從要我學(xué)轉(zhuǎn)變?yōu)槲乙獙W(xué)。剛進(jìn)入學(xué)校接觸到生物學(xué)時(shí),學(xué)生學(xué)習(xí)的知識(shí)都是生物學(xué)籠統(tǒng)概念和一些相關(guān)技術(shù),比較朦朧和模糊。通過(guò)該款軟件的翻譯和學(xué)習(xí),在老師的指引下才知道,原來(lái)生物學(xué)并不單調(diào)和枯燥,其中的世界奧妙無(wú)窮,只是學(xué)生沒(méi)有親身感受到生物學(xué)帶給他們的樂(lè)趣。學(xué)生會(huì)舉一反三地認(rèn)識(shí)到,目前社會(huì)上正在應(yīng)用的學(xué)科都不是單一的物理、數(shù)學(xué)、化學(xué)等,而是混和了多個(gè)學(xué)科的交叉學(xué)科在大放光彩。就生物信息學(xué)而言,就需要生物學(xué)知識(shí)、計(jì)算機(jī)知識(shí)、數(shù)學(xué)、統(tǒng)計(jì)學(xué)等各類知識(shí)。在對(duì)一個(gè)目標(biāo)求知的過(guò)程中可以學(xué)習(xí)到許多原有知識(shí)以外的知識(shí),達(dá)到了拓展生物學(xué)知識(shí)的目的。
2.提高了學(xué)生英語(yǔ)學(xué)習(xí)的興趣,減少了其對(duì)英語(yǔ)的畏懼和厭煩。學(xué)生為了興趣和心中的理想,對(duì)Artemis軟件的英文說(shuō)明進(jìn)行了翻譯。在此過(guò)程中,學(xué)生接觸了許多的生物學(xué)專業(yè)詞匯。在剛接觸到這些專業(yè)詞匯時(shí),學(xué)生很不適應(yīng)。對(duì)一個(gè)本科生而言,他們?cè)谟⒄Z(yǔ)學(xué)習(xí)的時(shí)候,沒(méi)有學(xué)習(xí)過(guò)它們。因此,專業(yè)生物學(xué)詞匯即使查詢多遍也不一定能記住,還會(huì)經(jīng)常忘記這些陌生的單詞。但是通過(guò)翻譯的時(shí)候反復(fù)不斷地查閱,看了數(shù)遍,以及一些語(yǔ)境的聯(lián)想,他們反而對(duì)這些單詞記憶深刻。大量的專業(yè)詞匯的認(rèn)識(shí)使得學(xué)生對(duì)這個(gè)專業(yè)也有了新的認(rèn)識(shí),學(xué)習(xí)成功的經(jīng)歷拓展了學(xué)生學(xué)習(xí)英語(yǔ)的興趣。
3.學(xué)生能夠勇敢地與國(guó)外專家交流。用英語(yǔ)與國(guó)外專家交流,剛開(kāi)始學(xué)生有些自卑,認(rèn)為自己英語(yǔ)不嫻熟,不能清晰地表達(dá)自己的真實(shí)的想法。從第一封信后,學(xué)生改變了自己的態(tài)度。英語(yǔ)只是交流的一種工具,雖然我們有時(shí)候用詞不準(zhǔn)確,但外國(guó)人也能夠理解其中的含義。從外國(guó)專家回信后,學(xué)生增強(qiáng)了自信,勇敢地走出了語(yǔ)言交流的障礙。除了電子郵件交流外,學(xué)生還在各個(gè)學(xué)術(shù)網(wǎng)站上發(fā)帖子詢問(wèn)相關(guān)問(wèn)題,積累出了自己的一套獲得專業(yè)知識(shí)的方法。他們覺(jué)得與國(guó)外專家進(jìn)行交流,更加高效,是更加直觀有益地收集數(shù)據(jù)的方法。進(jìn)入生物信息學(xué)相關(guān)的英文網(wǎng)站,不論是sanger公司的網(wǎng)站教程、員工培訓(xùn),還是在YAHOO上進(jìn)行提問(wèn),都是要全英文進(jìn)行,如何讓自己的英語(yǔ)書面表達(dá)更加專業(yè),又成為提高了英語(yǔ)水平的學(xué)習(xí)動(dòng)力。
4.充分利用時(shí)間去學(xué)習(xí)各種相關(guān)的知識(shí)。不同于以往需要查閱很多書本才能獲得某個(gè)知識(shí),由于電腦技術(shù)的強(qiáng)大力量,現(xiàn)在如果遇到難題學(xué)生就會(huì)立刻通過(guò)電腦查詢?nèi)ソ鉀Q,只要把握好大方向,一直向著某個(gè)方向前進(jìn)即可,而且進(jìn)度明確,進(jìn)行到某一步,都可以記下。而電腦自帶檢索功能,可以幫助分門別類而不會(huì)出現(xiàn)多個(gè)筆記本之間的混亂且可以隨時(shí)調(diào)用。充分利用時(shí)間,真正地將學(xué)習(xí)融入整個(gè)生活,學(xué)生不再覺(jué)得學(xué)習(xí)和生活空虛和無(wú)聊。
篇10
一 數(shù)據(jù)采集和處理
1.計(jì)算機(jī)在生命科學(xué)領(lǐng)域數(shù)據(jù)采集中的應(yīng)用
根據(jù)在線檢測(cè),如正常的溫度、壓力實(shí)驗(yàn)效果、代謝中間物質(zhì)的檢測(cè)、生物種群數(shù)目的統(tǒng)計(jì)等,這些數(shù)據(jù)采集數(shù)量大涉及面積廣,如果靠人工采集,投入量大,而且不符合需要。傳統(tǒng)方法、在線監(jiān)測(cè)數(shù)據(jù)的技術(shù)不成熟,在線監(jiān)測(cè)很難實(shí)現(xiàn)。
新型數(shù)據(jù)傳感器的研發(fā)并成功應(yīng)用,滿足了生命科學(xué)數(shù)據(jù)采集需要。新型數(shù)據(jù)傳感器利用監(jiān)測(cè)光、電、熱、輻射量等可以定量的物質(zhì)、生物物質(zhì)和酶等分子之間作用與光、熱等物理量存在定量的數(shù)學(xué)關(guān)系。根據(jù)這些基本原理,我們研發(fā)出特殊用途的電極和監(jiān)測(cè)系統(tǒng),如細(xì)胞電極、酶電極和分子電極,這些電極有很多優(yōu)點(diǎn),滿足信息采集的需要,物電信號(hào)轉(zhuǎn)換快、靈敏度高、測(cè)量誤差小,尤其是大量的數(shù)據(jù)采集儀器,如色譜法、質(zhì)譜法的應(yīng)用生物傳感器和生化測(cè)定儀器,其中核磁共振儀是特別重要的。
2.計(jì)算機(jī)對(duì)生命科學(xué)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的處理
數(shù)據(jù)處理包括處理、建立和求解各種生命科學(xué)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的學(xué)習(xí)生活方面的數(shù)學(xué)模型,用于控制和監(jiān)測(cè)的實(shí)驗(yàn)使用的數(shù)學(xué)模型,實(shí)驗(yàn)跟蹤生物量、生物參數(shù)以及生命科學(xué)和生物工程,包括優(yōu)化的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)。如果測(cè)定DNA序列中核苷酸的位置,需要處理和收集DNA光譜數(shù)據(jù);生物分子應(yīng)用放射性物質(zhì)跟蹤,從而研究生物分子的發(fā)展變化;利用計(jì)算機(jī)設(shè)計(jì)模擬技術(shù)來(lái)優(yōu)化生物工廠的建筑設(shè)計(jì),自動(dòng)分析和測(cè)量值的實(shí)驗(yàn)誤差的處理基因芯片技術(shù)是基因,基因研究須采用計(jì)算機(jī)對(duì)采集的數(shù)據(jù)進(jìn)行高效分析,從中獲得研究基因的眾多信息,再仔細(xì)處理從而得到相應(yīng)結(jié)果。在所有數(shù)據(jù)處理和數(shù)據(jù)分析研究,計(jì)算機(jī)的應(yīng)用和構(gòu)建生命科學(xué)意義上的數(shù)學(xué)模型是非常重要的,和生命科學(xué)研究的數(shù)學(xué)模型一樣,處于逐步從靜態(tài)到動(dòng)態(tài)的發(fā)展中。
二 計(jì)算機(jī)在生命科學(xué)中的應(yīng)用
1.計(jì)算機(jī)在生物信息學(xué)中的應(yīng)用
蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)需要通過(guò)計(jì)算機(jī)輔助方法進(jìn)行預(yù)判,預(yù)測(cè)過(guò)程中我們需要對(duì)核酸和蛋白質(zhì)等物質(zhì)三維結(jié)構(gòu)進(jìn)行精確測(cè)量,這種技術(shù)被用于生物大分子藥物設(shè)計(jì),已成為當(dāng)今社會(huì)的熱點(diǎn)。
世界人類基因課題組計(jì)劃所測(cè)定的30億個(gè)堿基中,人類3萬(wàn)個(gè)基因需要分析和核苷酸定位,進(jìn)而弄清楚其中所有功能單位的組織結(jié)構(gòu)形式以及調(diào)節(jié)機(jī)制,沒(méi)有計(jì)算機(jī)的幫助是難以想象的。
近年來(lái),基因組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、代謝組學(xué)的快速發(fā)展,迫切需要開(kāi)發(fā)新的數(shù)據(jù)分析技術(shù)和計(jì)算機(jī)軟件快速訪問(wèn)所需的數(shù)據(jù)和信息。生物信息研究除了可以提供基因結(jié)構(gòu)信息,還可以為蛋白質(zhì)和其他物質(zhì)提供空間結(jié)構(gòu)信息和電子結(jié)構(gòu)信息。
2.計(jì)算機(jī)數(shù)值方法在生命科學(xué)中的應(yīng)用
現(xiàn)代生物信息學(xué)中的數(shù)學(xué)模型是一個(gè)非常復(fù)雜的模型,涉及知識(shí)廣泛,而且需要很多方程耦合,比較常用的是非線性代數(shù)和微分方程耦合分析。為了研究這種復(fù)雜的數(shù)學(xué)模型,必須使用計(jì)算機(jī)數(shù)值方法。
因此,通過(guò)求解計(jì)算機(jī)數(shù)值分析方法的實(shí)際問(wèn)題,已成為一個(gè)重要的方法。只要數(shù)值方法的選擇、使用或計(jì)算機(jī)程序合理,就可以利用計(jì)算機(jī)解決數(shù)學(xué)模型的研究和計(jì)算實(shí)際問(wèn)題。由于數(shù)值計(jì)算方法的發(fā)展提出了許多實(shí)際問(wèn)題,計(jì)算機(jī)數(shù)值模擬軟件已經(jīng)在大量開(kāi)發(fā)。
設(shè)計(jì)的子程序用于解決實(shí)際計(jì)算問(wèn)題時(shí),應(yīng)用者需要掌握數(shù)值處理方法的知識(shí)和應(yīng)用能力。因?yàn)楫?dāng)使用任何復(fù)雜和完善的程序來(lái)解決特定的問(wèn)題都可能會(huì)遇到各種問(wèn)題,這些困難可能是由于某種原因造成的:數(shù)學(xué)模型并不能精確反映實(shí)際情況,用數(shù)值方法精確描述生命科學(xué)的實(shí)際過(guò)程是不合適的。這是由于該方法的誤差超過(guò)科學(xué)研究允許的實(shí)際誤差,從而反映出的結(jié)果和實(shí)際有很大差距。子程序的使用條件下實(shí)際的選擇不是在解決具體工程問(wèn)題,子程序未能適當(dāng)?shù)匦薷幕蛘{(diào)整。事實(shí)上,在應(yīng)用或使用任何子程序的時(shí)候,需要根據(jù)實(shí)際問(wèn)題的用戶的發(fā)展。作為子程序的最佳解決具體計(jì)算問(wèn)題的選擇上,需要更加厚實(shí)的基礎(chǔ)知識(shí),尤其是數(shù)值計(jì)算方法。因此生命科學(xué)科技實(shí)驗(yàn)人員或教學(xué)工作者總結(jié)掌握數(shù)值方法是非常重要的。
三 結(jié)束語(yǔ)
計(jì)算機(jī)在一個(gè)涉及廣泛的生命科學(xué)中的應(yīng)用,大大促進(jìn)了生命科學(xué)的發(fā)展,及在促進(jìn)相關(guān)產(chǎn)業(yè)發(fā)展中起到了很大的作用?;谀壳扒闆r,生命科學(xué)研究已不再僅僅是進(jìn)行科學(xué)實(shí)驗(yàn)觀察和記錄。
篇11
[文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼]A
[論文編號(hào)]1009―8097(2009)13―0179―03
網(wǎng)絡(luò)教育中,學(xué)習(xí)平臺(tái)是師生交流的一個(gè)重要的接口。是學(xué)生獲取信息和學(xué)習(xí)內(nèi)容的主要來(lái)源。學(xué)習(xí)平臺(tái)應(yīng)用的質(zhì)量對(duì)能否保證教學(xué)順利進(jìn)行,提高學(xué)生學(xué)習(xí)的效率,提高學(xué)生個(gè)性化學(xué)習(xí)的能力起關(guān)鍵性的作用。也直接影響到網(wǎng)絡(luò)教學(xué)的質(zhì)量。下面我們對(duì)在網(wǎng)絡(luò)教育中應(yīng)用教學(xué)平臺(tái)進(jìn)行導(dǎo)學(xué)進(jìn)行探討。
一 網(wǎng)絡(luò)教育的特點(diǎn)
網(wǎng)絡(luò)教育是利用計(jì)算機(jī)網(wǎng)絡(luò)技術(shù)、多媒體技術(shù)等現(xiàn)代信息技術(shù)手段開(kāi)展的新型教育形式,擁有傳統(tǒng)教育方式所無(wú)法比擬的優(yōu)勢(shì),具有鮮明的時(shí)代特征。
網(wǎng)絡(luò)教育有以下特點(diǎn):
師生分離。在網(wǎng)絡(luò)教育中,學(xué)生不再直接面對(duì)教師,而是面對(duì)計(jì)算機(jī)、學(xué)習(xí)平臺(tái)、教學(xué)資料和網(wǎng)絡(luò)課程等。學(xué)生大多數(shù)時(shí)間只是看到教師的“錄像”和在論壇上的留言。
學(xué)生自學(xué)為主。由于沒(méi)有教師面授,形成了以學(xué)習(xí)者為中心的學(xué)習(xí)活動(dòng)。學(xué)生必須主動(dòng)的學(xué)習(xí),積極的參與討論和交流。自主學(xué)習(xí)是學(xué)習(xí)者根據(jù)自己的學(xué)習(xí)能力、學(xué)習(xí)任務(wù)的要求,積極主動(dòng)地調(diào)整自己的學(xué)習(xí)策略和努力程度的過(guò)程。這需要學(xué)生具有較強(qiáng)的自我控制能力和自學(xué)能力。
個(gè)性化學(xué)習(xí)。學(xué)生可以根據(jù)自己的情況,自己決定在什么時(shí)候、在什么地方、以何種方式,進(jìn)行什么內(nèi)容的學(xué)習(xí)。可以按照自己的學(xué)習(xí)進(jìn)度進(jìn)行學(xué)習(xí)。
教師導(dǎo)學(xué)為主。教師作為學(xué)生學(xué)習(xí)的指導(dǎo)者,從講授為主轉(zhuǎn)向?qū)W(xué)為主。導(dǎo)學(xué)就是對(duì)學(xué)生的學(xué)習(xí)活動(dòng)、學(xué)習(xí)過(guò)程、學(xué)習(xí)方法進(jìn)行的指導(dǎo)。學(xué)生按教師事先編好的教材,學(xué)習(xí)指南進(jìn)行學(xué)習(xí)。同時(shí)師生可以在平臺(tái)上進(jìn)行充分的溝通和交流。
多維教學(xué)。網(wǎng)絡(luò)教育以多媒體技術(shù),計(jì)算機(jī)網(wǎng)絡(luò)為載體,可以進(jìn)行立體化教學(xué)。學(xué)習(xí)資源可以多樣化。有學(xué)習(xí)平臺(tái)提供的網(wǎng)絡(luò)課件,題庫(kù),教案庫(kù)等,也可以有來(lái)自互聯(lián)網(wǎng)的學(xué)習(xí)資源和來(lái)自學(xué)生中間的學(xué)習(xí)資源。學(xué)習(xí)方式也可以多樣化,以自主的個(gè)別化學(xué)習(xí)和交互式的集體協(xié)同學(xué)習(xí)相結(jié)合。追求人際、人機(jī)、人網(wǎng)的三維動(dòng)態(tài)立體教學(xué)。實(shí)現(xiàn)網(wǎng)授與面授相結(jié)合;在線學(xué)習(xí)與線外學(xué)習(xí)相結(jié)合;在校學(xué)習(xí)與在職學(xué)習(xí)相結(jié)合等。
二 教學(xué)平臺(tái)的服務(wù)功能
我校05年引進(jìn)了Blackborld教學(xué)平臺(tái)進(jìn)行網(wǎng)絡(luò)教學(xué)活動(dòng)。
Blackboard網(wǎng)絡(luò)教學(xué)平臺(tái)基于網(wǎng)絡(luò)技術(shù)和多媒體技術(shù)進(jìn)行人機(jī)交互。以瀏覽器/服務(wù)器(B/S)技術(shù)、信息安全技術(shù)、門戶技術(shù)、數(shù)據(jù)庫(kù)和信息集成技術(shù)等為基礎(chǔ),以聲、像、圖、文等多種媒體信息與計(jì)算機(jī)網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行信息交流。
教學(xué)平臺(tái)集文本、圖象及視頻、音頻、動(dòng)畫為一體,可以實(shí)現(xiàn)教師在線授課,在線測(cè)驗(yàn),在線答疑,同步和異步討論,批改作業(yè)、學(xué)習(xí)跟蹤、學(xué)習(xí)統(tǒng)計(jì)、虛擬課堂、小組學(xué)習(xí)、協(xié)作學(xué)習(xí)和包括十幾種題型的題庫(kù)等功能??蛇M(jìn)行知識(shí)管理和學(xué)習(xí),教學(xué)跟蹤管理和教學(xué)過(guò)程監(jiān)控;實(shí)現(xiàn)教學(xué)資源共享,教學(xué)方式和學(xué)習(xí)方式多樣化;平臺(tái)的討論交流論壇等實(shí)現(xiàn)教師與學(xué)生、學(xué)生與學(xué)生之間的交流互動(dòng)。
目前我校平臺(tái)用戶已經(jīng)4萬(wàn)多,平臺(tái)上課程有1000多門。平臺(tái)成為了學(xué)校教學(xué)活動(dòng)的中心。院系教師、教學(xué)管理人員、教務(wù)管理人員、校外學(xué)習(xí)中心管理人員、課件制作人員和學(xué)生都圍繞著平臺(tái)。平臺(tái)成了大家聯(lián)系的橋梁,交互的接口。
三 教學(xué)平臺(tái)的門戶
門戶是對(duì)教學(xué)管理實(shí)施的重要部分。Blackboard門戶社區(qū)平臺(tái)為我們進(jìn)行門戶管理提供了方便。我們目前建立的網(wǎng)絡(luò)教育學(xué)院門戶包括以下部分。
網(wǎng)絡(luò)教育學(xué)院選項(xiàng)卡:包括我的課程、網(wǎng)院通知模塊、學(xué)習(xí)調(diào)查模塊、網(wǎng)絡(luò)學(xué)習(xí)指南、學(xué)生常見(jiàn)技術(shù)問(wèn)題解答和網(wǎng)院主頁(yè)的鏈接等。
網(wǎng)絡(luò)教育學(xué)院社區(qū)選項(xiàng)卡:機(jī)構(gòu)討論板里面有自2006年3月以來(lái)的每個(gè)學(xué)期和學(xué)生互動(dòng)的論壇、有教學(xué)問(wèn)題交流區(qū)、教務(wù)問(wèn)題交流區(qū)、和平臺(tái)技術(shù)問(wèn)題交流區(qū)。2008年3月統(tǒng)計(jì)帖子總數(shù)有1萬(wàn)多。
另外在組織社區(qū),我們建立了所有網(wǎng)絡(luò)教育學(xué)院22個(gè)專業(yè)和50個(gè)學(xué)習(xí)中心的組織。
網(wǎng)院教師之家選項(xiàng)卡:這個(gè)欄目只有有關(guān)教師能看到,有課件制作工作站、培訓(xùn)專欄、公告專欄和交流園地等。
我們還根據(jù)網(wǎng)絡(luò)教育學(xué)院的需求,創(chuàng)建了一些組織。如教務(wù)管理組織、教學(xué)管理組織、學(xué)習(xí)中心管理組織等。
四 對(duì)網(wǎng)絡(luò)教育學(xué)生的導(dǎo)學(xué)和服務(wù)支持
網(wǎng)絡(luò)教育學(xué)院的學(xué)生絕大部分都是在職人員,有著不同的學(xué)習(xí)背景、工作經(jīng)歷以及年齡特征,大多利用業(yè)余時(shí)間上平臺(tái)學(xué)習(xí)。我們需要從各個(gè)方面對(duì)他們進(jìn)行導(dǎo)學(xué)和服務(wù)支持。
1 遠(yuǎn)程學(xué)習(xí)指南
網(wǎng)絡(luò)教育在教與學(xué)上時(shí)、空分離的特點(diǎn),要求參與網(wǎng)絡(luò)學(xué)習(xí)的學(xué)生必須具備一定的自學(xué)、自治能力。但是,目前參與網(wǎng)絡(luò)學(xué)習(xí)的學(xué)生大多是在職的。有的工作繁忙,有的缺乏網(wǎng)絡(luò)學(xué)習(xí)經(jīng)驗(yàn)和自主學(xué)習(xí)能力,和在校全日制本科生比,基礎(chǔ)參差不齊。為了幫助同學(xué)們盡快掌握科學(xué)、有效的學(xué)習(xí)方法,合理地安排學(xué)習(xí)時(shí)間、制定學(xué)習(xí)計(jì)劃,充分地利用各種學(xué)習(xí)資源,培養(yǎng)自治能力,“遠(yuǎn)程學(xué)習(xí)指南”就是這樣一門對(duì)網(wǎng)院學(xué)生進(jìn)行導(dǎo)學(xué)的課程。
《遠(yuǎn)程學(xué)習(xí)指南》課程,對(duì)所有新生開(kāi)放。課程有下列欄目:
教學(xué)通知,有教學(xué)管理的教師的教學(xué)方面的通知。
管理規(guī)定,有中山大學(xué)現(xiàn)代遠(yuǎn)程教育學(xué)籍管理暫行辦法,中山大學(xué)現(xiàn)代遠(yuǎn)程教育畢業(yè)論文實(shí)施細(xì)則,中山大學(xué)授予遠(yuǎn)程教育本科畢業(yè)生學(xué)士學(xué)位實(shí)施辦法等。
學(xué)習(xí)指導(dǎo),有遠(yuǎn)程學(xué)習(xí)指南文檔,遠(yuǎn)程教育導(dǎo)學(xué)課件,學(xué)習(xí)平臺(tái)操作指南文檔,相關(guān)插件下載等。
專業(yè)信息,有網(wǎng)院22個(gè)專業(yè)的信息。
專業(yè)導(dǎo)學(xué),有每個(gè)專業(yè)的導(dǎo)學(xué)課件。
教學(xué)計(jì)劃,有每學(xué)期各專業(yè)教學(xué)計(jì)劃。
教學(xué)安排,有每學(xué)期的教學(xué)工作安排。
表格下載,有各種表格下載,如免修申請(qǐng)表、重修申請(qǐng)表等。
調(diào)查問(wèn)卷,對(duì)學(xué)生進(jìn)行民意調(diào)查等。
教學(xué)問(wèn)答,有常見(jiàn)教學(xué)問(wèn)題解答,平臺(tái)常見(jiàn)技術(shù)問(wèn)題解答等。
2 網(wǎng)院學(xué)生常見(jiàn)問(wèn)題(FAQ)
網(wǎng)院學(xué)生住在校外,有的在辦公室,有的在家里上網(wǎng)。網(wǎng)絡(luò)什么情況都有。有的用電信網(wǎng)、網(wǎng)通、聯(lián)通、鐵通、XX寬頻、XX寬帶等。情況比較復(fù)雜。
網(wǎng)院學(xué)生特別文科學(xué)生,有的不熟悉電腦和網(wǎng)絡(luò),經(jīng)常打電話來(lái)咨詢。我們將一些常見(jiàn)問(wèn)題整理成FAO,放在平臺(tái)上。
網(wǎng)院學(xué)生常見(jiàn)的問(wèn)題(FAQ),內(nèi)容有:
平臺(tái)運(yùn)行條件。有硬件要求,軟件要求,課件的瀏覽要求。
檢測(cè)網(wǎng)絡(luò)故障的一些命令。如Ping命令的使用方法,Traced命令的使用方法。
影響網(wǎng)絡(luò)速度的幾個(gè)因素和測(cè)量網(wǎng)絡(luò)速度的工具。
故障分類。將故障進(jìn)行分類,有網(wǎng)絡(luò)、電腦和系統(tǒng)軟件等客戶端問(wèn)題,平臺(tái)應(yīng)用和課程問(wèn)題,課程設(shè)置問(wèn)題,教學(xué)教務(wù)問(wèn)題,課程作業(yè)問(wèn)題等。
故障原因和解決方法。提供各類故障的解決辦法等。
3 學(xué)生交流論壇
為了即時(shí)與學(xué)生進(jìn)行交流,我們?cè)谄脚_(tái)上建立了下列論壇:
課程論壇:每個(gè)課程里面都有。交流課程內(nèi)容有關(guān)的問(wèn)題,教師每周至少有三個(gè)時(shí)間段在學(xué)習(xí)平臺(tái)上解答問(wèn)題,教師也會(huì)在課程論壇中組織課程問(wèn)題的討論。
由學(xué)科教師管理。
教學(xué)問(wèn)題交流區(qū):交流教學(xué)安排、輔導(dǎo)答疑、作業(yè)、網(wǎng)絡(luò)課件、畢業(yè)論文等方面的問(wèn)題,教學(xué)管理人員每天上網(wǎng)回答問(wèn)題。
教務(wù)問(wèn)題交流區(qū):交流關(guān)于平臺(tái)帳號(hào)、考試、成績(jī)、學(xué)籍(含休學(xué)、復(fù)學(xué)、轉(zhuǎn)中心、轉(zhuǎn)專業(yè)等)、畢業(yè)等方面的問(wèn)題。教務(wù)管理人員每天上網(wǎng)回答問(wèn)題。
平臺(tái)技術(shù)問(wèn)題交流區(qū):交流關(guān)于學(xué)習(xí)平臺(tái)使用技術(shù)方面的問(wèn)題。由信息與網(wǎng)絡(luò)中心的技術(shù)人員解答。
學(xué)生交流區(qū):學(xué)習(xí)中心同學(xué)之間以及管理人員與同學(xué)之間的交流區(qū),也是學(xué)習(xí)中心各種信息的地方。由學(xué)習(xí)中心教學(xué)管理人員負(fù)責(zé)。
4 教務(wù)管理組織
我們還建立了《教務(wù)管理》組織,在教務(wù)管理組織中可以對(duì)學(xué)生進(jìn)行分類管理,如分年級(jí)、分專業(yè)等。
教務(wù)管理組織有下列欄目:
學(xué)籍管理,有學(xué)籍管理方面的規(guī)定。
考務(wù)工作,有考務(wù)工作的相關(guān)規(guī)定,考試安排,考場(chǎng)安排等。
成績(jī)查詢,有成績(jī)查詢系統(tǒng)。
統(tǒng)考信息,有統(tǒng)考信息和相關(guān)規(guī)定。
畢業(yè)與學(xué)位,有相關(guān)條例,畢業(yè)生信息采集.學(xué)位英語(yǔ),主干課程考試等。
表格下載,各種表格下載。
討論板,有交流論壇。
五 對(duì)網(wǎng)絡(luò)教育教師的培訓(xùn)和管理
網(wǎng)院沒(méi)有教師編制,教師都是聘請(qǐng)的學(xué)校各個(gè)院系的教師,充分利用了中山大學(xué)優(yōu)秀的教師資源,依托學(xué)校的有形和無(wú)形的資源辦學(xué)。但教師也面臨著教師角色的轉(zhuǎn)變:
教師由原來(lái)的面授轉(zhuǎn)為網(wǎng)授
由教師為中心轉(zhuǎn)為學(xué)生為中心
教師的概念也起了變化,包括了由主講教師、輔導(dǎo)教師、教學(xué)設(shè)計(jì)技術(shù)人員以及管理人員集合組成的一個(gè)團(tuán)體
為了完成教師的轉(zhuǎn)型,我們利用《遠(yuǎn)程教學(xué)指南》課程,對(duì)教師進(jìn)行指導(dǎo)。遠(yuǎn)程教學(xué)指南課程有下列欄目:
管理文件,有教育部遠(yuǎn)程教育管理文件,學(xué)校遠(yuǎn)程教育管理文件等。
教師培訓(xùn),有我們編寫的主講教師工作手冊(cè),課件錄制規(guī)范和指南,教學(xué)輔導(dǎo)工作培訓(xùn)文件,中山大學(xué)現(xiàn)代遠(yuǎn)程平臺(tái)培訓(xùn),學(xué)期教學(xué)輔導(dǎo)工作安排及要求等。
教學(xué)計(jì)劃,有學(xué)期各專業(yè)教學(xué)計(jì)劃。
教學(xué)安排,有學(xué)期教學(xué)工作安排。
遠(yuǎn)教會(huì)議,有遠(yuǎn)程教育會(huì)議資料。
遠(yuǎn)教研究,有學(xué)習(xí)支持服務(wù),遠(yuǎn)程教育質(zhì)量,國(guó)際視野,網(wǎng)絡(luò)課程建設(shè)等。
遠(yuǎn)教網(wǎng)站,有相關(guān)網(wǎng)站的鏈接。
交流園地,有交流論壇。
網(wǎng)院對(duì)教師也有一些管理規(guī)定。如輔導(dǎo)答疑規(guī)定:每周至少三次登陸學(xué)習(xí)平臺(tái)進(jìn)行輔導(dǎo)答疑,每次至少30分鐘。至少組織兩次關(guān)于課程問(wèn)題的討論或案例分析。和作業(yè)規(guī)定:每學(xué)期至少布置兩次在線作業(yè),作業(yè)成績(jī)占總評(píng)成績(jī)的20%等。網(wǎng)院有專門的巡教巡學(xué)人員。
六 對(duì)校外學(xué)習(xí)中心的培訓(xùn)和管理
校外學(xué)習(xí)中心是接受學(xué)校的委托,根據(jù)學(xué)校的統(tǒng)一要求和工作安排,配合學(xué)校進(jìn)行招生宣傳、生源組織、學(xué)生學(xué)習(xí)支持、學(xué)籍和日常管理,開(kāi)展現(xiàn)代遠(yuǎn)程教育支持服務(wù)的機(jī)構(gòu)。
學(xué)習(xí)中心分布在全省各地,利用平臺(tái)把它們集中管理是最有效的辦法。
我們建立的《學(xué)習(xí)中心管理》組織,存放與學(xué)習(xí)中心有關(guān)的各種信息,是學(xué)習(xí)中心進(jìn)行交流的地方。欄目有:
管理文件,有相關(guān)的教學(xué)管理文件。
教學(xué)計(jì)劃,有學(xué)期各專業(yè)教學(xué)計(jì)劃。
教學(xué)安排,有學(xué)期教學(xué)工作安排。
培訓(xùn)資料,有教學(xué)管理培訓(xùn)資料,學(xué)習(xí)支持服務(wù)培訓(xùn)資料,技術(shù)人員培訓(xùn)資料等。
資料下載,有相關(guān)的資料下載。
交流天地,有交流論壇。
七 平臺(tái)上網(wǎng)絡(luò)教育課程的建設(shè)
1 課程規(guī)范統(tǒng)一
網(wǎng)絡(luò)課程是重要的教學(xué)資源。我們依托平臺(tái)來(lái)建立網(wǎng)絡(luò)課程。網(wǎng)絡(luò)教育學(xué)院的網(wǎng)絡(luò)課程,其講授型課件由學(xué)校信息與網(wǎng)絡(luò)中心統(tǒng)一制作和上傳,制定了統(tǒng)一規(guī)范。
考慮到網(wǎng)院學(xué)生分散性、業(yè)余性的特征,缺少與教師面對(duì)面交流機(jī)會(huì)。他們?nèi)科脚_(tái)提供信息。所以平臺(tái)上的東西都要規(guī)范化。要讓他們一上平臺(tái)就能夠很容易找到自己所要的東西。所以我們的界面都力求統(tǒng)一。
網(wǎng)院課程的五個(gè)統(tǒng)一:
課程規(guī)范統(tǒng)一
講授型課件制作統(tǒng)一
課程論壇形式統(tǒng)一
在線作業(yè)形式統(tǒng)一
注冊(cè)管理由學(xué)院統(tǒng)一
2 網(wǎng)絡(luò)教育精品課程的建設(shè)
我校網(wǎng)絡(luò)教育精品課程建設(shè)理念是以育人為根本、以培養(yǎng)應(yīng)用型人才為導(dǎo)向、以服務(wù)社會(huì)為己任、以社會(huì)評(píng)價(jià)為標(biāo)準(zhǔn)。并通過(guò)相應(yīng)的制度予以保障。
信息與網(wǎng)絡(luò)中心負(fù)責(zé)網(wǎng)絡(luò)教育精品課程建設(shè)的技術(shù)支撐工作,對(duì)教師進(jìn)行教育技術(shù)培訓(xùn),選派優(yōu)秀的教育技術(shù)學(xué)專家和技術(shù)人員負(fù)責(zé)精品課程的設(shè)計(jì)和技術(shù)。從而使網(wǎng)絡(luò)課程建設(shè)從技術(shù)上得到保障。
我校網(wǎng)絡(luò)教育精品課程都建設(shè)在Blackboard教學(xué)平臺(tái)上,充分利用該平臺(tái)強(qiáng)大的人機(jī)交互功能。如討論板、虛擬課堂、小組等。
3 教學(xué)設(shè)計(jì)中體現(xiàn)平臺(tái)導(dǎo)學(xué)的元素
我們注重課程的教學(xué)設(shè)計(jì),在教學(xué)設(shè)計(jì)中體現(xiàn)平臺(tái)導(dǎo)學(xué)的元素。
《刑事訴訟法原理》網(wǎng)絡(luò)教育課程教學(xué)設(shè)計(jì)。運(yùn)用了系統(tǒng)工程框架、對(duì)象導(dǎo)向框架和法治系統(tǒng)工程的方法,充分借鑒集文字、圖像、聲音于一體的多媒體表現(xiàn)形式。綜合集成多種與刑事訴訟相關(guān)的法律、制度、專業(yè)理論和知識(shí)、案例、教師與學(xué)生等資源,形成具有整體學(xué)習(xí)與交流功能的開(kāi)放型知識(shí)系統(tǒng)。注重將法學(xué)教學(xué)(模型)與法治實(shí)踐(原型)緊密結(jié)合,注重講述、展示法治系統(tǒng)的實(shí)際運(yùn)籌與實(shí)現(xiàn)過(guò)程,不僅把“交互研討型”的案例教學(xué)法引入刑事訴訟法學(xué)教學(xué)之中,而且刻意把“問(wèn)題解決型”的現(xiàn)代學(xué)習(xí)理論融入學(xué)生的自學(xué)過(guò)程之中。例如“模擬法庭”就很受學(xué)生的歡迎。
《生物統(tǒng)計(jì)學(xué)》課程教學(xué)設(shè)計(jì)。凸顯以設(shè)立學(xué)習(xí)目標(biāo)為核心,采取任務(wù)驅(qū)動(dòng)的方式,訓(xùn)練學(xué)生主動(dòng)參與教學(xué)的意識(shí)和強(qiáng)化創(chuàng)新實(shí)踐能力。自主學(xué)習(xí)任務(wù)內(nèi)容,依照教學(xué)進(jìn)度安排,學(xué)生需要分階段完成3篇指定的課程綜述、調(diào)查或研究小論文。在教學(xué)設(shè)計(jì)中,充分發(fā)揮平臺(tái)的優(yōu)勢(shì),通過(guò)平臺(tái)的導(dǎo)向作用,指導(dǎo)學(xué)生學(xué)習(xí)。平臺(tái)上整合了大量的數(shù)據(jù)庫(kù)的網(wǎng)絡(luò)資源和統(tǒng)計(jì)學(xué)軟件的學(xué)習(xí)使用。利用各種搜索、論壇、博客、調(diào)查、電子郵件、虛擬課堂、聊天室等為課程營(yíng)造出一個(gè)良好的人機(jī)交互的教學(xué)環(huán)境,鼓勵(lì)學(xué)生積極參與討論,完成課程學(xué)習(xí)的選題研究報(bào)告和作業(yè)。提高了學(xué)生的創(chuàng)新能力。通過(guò)多階段多任務(wù)的教學(xué),解答問(wèn)題和開(kāi)展創(chuàng)新研究。特別組織了課程的小型學(xué)術(shù)討論會(huì),增進(jìn)了學(xué)生的協(xié)作和交流。
《生物信息學(xué)》課程教學(xué)設(shè)計(jì)。生物信息學(xué)本身是一個(gè)飛躍發(fā)展的新興學(xué)科。模式生物測(cè)序工作的高速增長(zhǎng),公共數(shù)據(jù)庫(kù)數(shù)據(jù)的指數(shù)增長(zhǎng),研究方法日新月異的發(fā)展,注定該學(xué)科的教學(xué)內(nèi)容需要不斷更新和調(diào)整,以便及時(shí)跟上研究工作前進(jìn)的步伐。課程的教學(xué)過(guò)程是一個(gè)在平臺(tái)上共建課程的探索過(guò)程。實(shí)現(xiàn)以學(xué)生為主和以教師為輔的自主發(fā)現(xiàn)式學(xué)習(xí)、合作交流式學(xué)習(xí)、實(shí)踐創(chuàng)作式學(xué)習(xí)、資源開(kāi)發(fā)式學(xué)習(xí)等新型學(xué)習(xí),追求立體化教學(xué)效果。借助和利用網(wǎng)絡(luò)資源充實(shí)教學(xué)材料和內(nèi)容,由師生共建資源庫(kù),不斷完善課程的教學(xué)。在Blackborld學(xué)習(xí)系統(tǒng)上構(gòu)建了生物信息學(xué)學(xué)習(xí)的專業(yè)平臺(tái)。
八 結(jié)束語(yǔ)
以上我們從網(wǎng)絡(luò)教育的特點(diǎn),教學(xué)平臺(tái)的門戶,對(duì)網(wǎng)絡(luò)教育學(xué)生的導(dǎo)學(xué)和服務(wù)支持,對(duì)網(wǎng)絡(luò)教育教師的培訓(xùn)和管理,對(duì)校外學(xué)習(xí)中心的培訓(xùn)和管理,平臺(tái)上網(wǎng)絡(luò)教育課程的建設(shè)等幾個(gè)方面對(duì)應(yīng)用教學(xué)平臺(tái)進(jìn)行導(dǎo)學(xué)進(jìn)行了論述。我們要把教學(xué)過(guò)程看作是一個(gè)動(dòng)態(tài)發(fā)展的、教與學(xué)統(tǒng)一的、交互影響和交互活動(dòng)過(guò)程。針對(duì)不同學(xué)科的特點(diǎn),和不同學(xué)生的特點(diǎn),運(yùn)用合適的教學(xué)模式和導(dǎo)學(xué)方法,更好地利用教學(xué)平臺(tái)的各種功能來(lái)進(jìn)行導(dǎo)學(xué)。
參考文獻(xiàn)
篇12
循證醫(yī)學(xué)是臨床醫(yī)學(xué)與現(xiàn)代信息學(xué)、衛(wèi)生統(tǒng)計(jì)學(xué)、流行病學(xué)相結(jié)合的典范,其核心思想是任何臨床醫(yī)療決策的制定都應(yīng)以最新的系統(tǒng)評(píng)價(jià)結(jié)果為科學(xué)依據(jù),而不能單憑醫(yī)生的臨床經(jīng)驗(yàn)或依據(jù)少量相關(guān)文獻(xiàn)信息來(lái)決定病人的診治方案。循證醫(yī)學(xué)主要方法是檢索關(guān)于某種疾病診療方案的隨機(jī)對(duì)照實(shí)驗(yàn),運(yùn)用現(xiàn)代信息學(xué)、衛(wèi)生統(tǒng)計(jì)學(xué)、流行病學(xué)方法對(duì)實(shí)驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行嚴(yán)格的系統(tǒng)評(píng)價(jià)或分析(Meta―analysis),得出評(píng)價(jià)結(jié)果,為臨床研究和醫(yī)療決策提供可靠又準(zhǔn)確的科學(xué)證據(jù)。臨床醫(yī)務(wù)人員要依據(jù)循證醫(yī)學(xué)決定診療決策,需要醫(yī)學(xué)圖書館員利用圖書館豐富的信息資源、嫻熟的檢索技術(shù)和科學(xué)的統(tǒng)計(jì)方法對(duì)文獻(xiàn)信息進(jìn)行辨別和評(píng)判,篩選確切的文獻(xiàn),并對(duì)其進(jìn)行加工、分析和凝練,形成更高層次的信息產(chǎn)品,從而更好地幫助醫(yī)生獲得最佳的醫(yī)學(xué)證據(jù)。因此,循證醫(yī)學(xué)研究應(yīng)該一種多學(xué)科相互融合、相互協(xié)作的跨學(xué)科科研模式,在這種研究模式下,高校圖書館的情報(bào)服務(wù)機(jī)構(gòu)為臨床醫(yī)生提供的循證醫(yī)學(xué)情報(bào)信息服務(wù),就必須適應(yīng)循證醫(yī)學(xué)這種新興學(xué)科的特點(diǎn),所需的情報(bào)資源必須經(jīng)過(guò)多學(xué)科人員協(xié)同式的信息挖掘、信息整合,才能為醫(yī)生提供有價(jià)值的循證醫(yī)學(xué)信息服務(wù)。
1 國(guó)內(nèi)循證醫(yī)學(xué)情報(bào)服務(wù)的現(xiàn)狀
“國(guó)外循證醫(yī)學(xué)環(huán)境下醫(yī)學(xué)院校圖書館的信息服務(wù)開(kāi)展較早,目前已形成一定的模式。我國(guó)對(duì)于循證醫(yī)學(xué)信息服務(wù)發(fā)展模式的探討尚處于初步階段,發(fā)展機(jī)制還不健全,亟須在循證醫(yī)學(xué)實(shí)踐中逐步完善”[2]。
我國(guó)循證醫(yī)學(xué)起步較晚,但發(fā)展很快。1999年,我國(guó)在華西醫(yī)科大學(xué)成立了中國(guó)循證醫(yī)學(xué)(Cochrane)中心,并加入了國(guó)際循證醫(yī)學(xué)(Cochrane)協(xié)作網(wǎng),這些舉措使循證醫(yī)學(xué)得到了更多的關(guān)注,極大地促進(jìn)了我國(guó)循證醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的發(fā)展。循證醫(yī)學(xué)研究有自己固有的模式:“以建立循證醫(yī)學(xué)臨床證據(jù)咨詢中心為服務(wù)基礎(chǔ),以部分中心成員進(jìn)入病房主動(dòng)參與臨床實(shí)踐為輔助于段。服務(wù)過(guò)程分為;獲取問(wèn)題、查詢證據(jù)、服務(wù)質(zhì)量評(píng)價(jià)等三個(gè)階段,通過(guò)服務(wù)質(zhì)量評(píng)價(jià)階段,中心成員既可以跟蹤所提供證據(jù)在臨床實(shí)踐中的有用性,也可以根據(jù)反饋對(duì)臨床情報(bào)服務(wù)工作進(jìn)行調(diào)整和改進(jìn)”[3]。在循證醫(yī)學(xué)信息服務(wù)過(guò)程中需要建立良好的溝通機(jī)制,主要體現(xiàn)在臨床證據(jù)的檢索、評(píng)價(jià)和提供整個(gè)過(guò)程,最終滿足醫(yī)師的臨床需要。
醫(yī)學(xué)圖書館及情報(bào)信息服務(wù)機(jī)構(gòu)充分認(rèn)識(shí)和掌握循證醫(yī)學(xué)的三個(gè)階段模式,有利于在循證過(guò)程中深入了解循證醫(yī)學(xué)中存在的信息轉(zhuǎn)化障礙,從而有針對(duì)性地開(kāi)展相關(guān)信息服務(wù),促進(jìn)循證醫(yī)學(xué)中系統(tǒng)評(píng)價(jià)的順利進(jìn)行。但由于在循證醫(yī)學(xué)研究中涉及醫(yī)學(xué)信息技能、臨床信息技能、預(yù)防醫(yī)學(xué)與公共衛(wèi)生、生物信息學(xué)及衛(wèi)生統(tǒng)計(jì)學(xué)等多個(gè)學(xué)科領(lǐng)域,因此,為循證醫(yī)學(xué)提供信息服務(wù)就需要具有較高信息技術(shù)素養(yǎng),交流溝通能力,以及多學(xué)科縱深背景的復(fù)合型知識(shí)人才。但作為一個(gè)學(xué)科館員或者情報(bào)人員往往達(dá)不到多學(xué)科知識(shí)的要求,這就需要按照以上幾個(gè)方面的需要?jiǎng)?chuàng)立協(xié)同化科研情報(bào)服務(wù)團(tuán)隊(duì),從團(tuán)隊(duì)的學(xué)科建設(shè)、服務(wù)模式、服務(wù)途徑等幾個(gè)方面來(lái)創(chuàng)新現(xiàn)有的情報(bào)信息服務(wù)策略,從而為國(guó)內(nèi)醫(yī)學(xué)圖書館、信息服務(wù)機(jī)構(gòu)組建循證醫(yī)學(xué)協(xié)同化情報(bào)服務(wù)團(tuán)隊(duì)及創(chuàng)新信息服務(wù)的新模式提供參考。
2 組建協(xié)同化循證醫(yī)學(xué)服務(wù)團(tuán)隊(duì)及完善相關(guān)信息資源
2.1 組建協(xié)同化循證醫(yī)學(xué)服務(wù)團(tuán)隊(duì)
當(dāng)前很多高校圖書館情報(bào)機(jī)構(gòu)的人才結(jié)構(gòu)配備不合理、信息資源保障體系不完善、服務(wù)行為不規(guī)范、服務(wù)模式缺乏新意、信息服務(wù)內(nèi)容不深入、服務(wù)范圍狹窄等[4],這些誤區(qū)容易導(dǎo)致圖書館的服務(wù)成為形象工程,影響高校圖書館的長(zhǎng)遠(yuǎn)發(fā)展。因此,對(duì)組建協(xié)同化循證醫(yī)學(xué)服務(wù)團(tuán)隊(duì)、完善相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)信息資源系統(tǒng)進(jìn)行研究,并根據(jù)發(fā)現(xiàn)的問(wèn)題提出相應(yīng)的解決對(duì)策,具有重要的科學(xué)意義和實(shí)際指導(dǎo)作用。
2.1.1 有針對(duì)性地引進(jìn)高素質(zhì)人才。①選擇具有圖書館情報(bào)學(xué)專業(yè)知識(shí),專業(yè)技能強(qiáng),業(yè)務(wù)素質(zhì)高的人才。②根據(jù)高校的學(xué)科優(yōu)勢(shì)或者學(xué)科特色選擇對(duì)口學(xué)科背景深,熟悉相關(guān)專業(yè)發(fā)展動(dòng)態(tài)、發(fā)展前沿的人才。③選擇既有一定的醫(yī)學(xué)背景,又熟練圖書館情報(bào)專業(yè)知識(shí)和技能,可塑性強(qiáng)的復(fù)合型人才,為臨床醫(yī)生提供針對(duì)性的循證醫(yī)學(xué)信息服務(wù)。
2.1.2 加強(qiáng)對(duì)現(xiàn)有人才的開(kāi)發(fā),提升其綜合水平。在現(xiàn)有情報(bào)人員潛能開(kāi)發(fā)方面,高校情報(bào)服務(wù)機(jī)構(gòu)在人才、資金、技術(shù)等有限的條件下,必須不斷加強(qiáng)現(xiàn)有人才的開(kāi)發(fā),提升其綜合水平。①?gòu)默F(xiàn)有的人員中選拔既有一定的醫(yī)學(xué)背景又有圖書情報(bào)專業(yè)知識(shí)和技能的情報(bào)人員進(jìn)行開(kāi)發(fā)和培養(yǎng),強(qiáng)化信息服務(wù)職業(yè)素養(yǎng)教育;加強(qiáng)對(duì)館員工作中的主動(dòng)性、個(gè)性化、增值意識(shí)的培養(yǎng);提升情報(bào)服務(wù)質(zhì)量的業(yè)務(wù)培訓(xùn),包括知識(shí)發(fā)現(xiàn)、知識(shí)挖掘、數(shù)掘融合、推送技術(shù)、智能搜索等能力的培訓(xùn),為用戶提供所急需的、個(gè)性化的、深層次的循證醫(yī)學(xué)信息等。②情報(bào)服務(wù)機(jī)構(gòu)應(yīng)為情報(bào)人員提供相關(guān)學(xué)科知識(shí)學(xué)習(xí)的機(jī)會(huì),加深其對(duì)相關(guān)學(xué)科的了解,特別是醫(yī)學(xué)、生物信息學(xué)、衛(wèi)生統(tǒng)計(jì)學(xué)等,能熟練地運(yùn)用計(jì)算機(jī)分析數(shù)據(jù),并樹(shù)立他們終生學(xué)習(xí)的理念,確保情報(bào)人員的知識(shí)和能力不落伍,能及時(shí)掌握科研發(fā)展動(dòng)態(tài),從而更好地為臨床醫(yī)生提供相關(guān)的循證醫(yī)學(xué)信息服務(wù)。
2.2 循證醫(yī)學(xué)相關(guān)信息資源的建設(shè)
圍繞協(xié)同化循證醫(yī)學(xué)服務(wù)團(tuán)隊(duì),調(diào)查統(tǒng)計(jì)不同科研團(tuán)隊(duì)的特色信息資源需求,以最大限度地滿足各個(gè)循證醫(yī)學(xué)科研團(tuán)隊(duì)信息需求為前提,建設(shè)具有特色的數(shù)據(jù)庫(kù)信息資源,他是開(kāi)展面向循證醫(yī)學(xué)協(xié)同化情報(bào)服務(wù)的基礎(chǔ)。筆者認(rèn)為高校圖書館在建設(shè)本校特色數(shù)據(jù)庫(kù)資源體系時(shí)勿追求“ 大而全”,而是從學(xué)?;蛘吒綄籴t(yī)院的優(yōu)勢(shì)學(xué)科,以及重點(diǎn)學(xué)科,相關(guān)協(xié)同化循證醫(yī)學(xué)服務(wù)團(tuán)隊(duì)的信息需求等方面,要以“協(xié)調(diào)匹配、彰顯特色、成本節(jié)約、合理配置”為原則[5],構(gòu)建有自己特色的文獻(xiàn)信息資源體系。同時(shí),要盡可能地加強(qiáng)對(duì)數(shù)據(jù)庫(kù)、網(wǎng)絡(luò)資源的整合,建立一個(gè)集所有或大部分?jǐn)?shù)據(jù)資源的網(wǎng)絡(luò)化平臺(tái)、檢索界面,方便科研人員熟悉、利用數(shù)據(jù)庫(kù)資源[6]。[HJ1.25mm]
3 創(chuàng)新循證醫(yī)學(xué)信息服務(wù)的新模式
3.1 組建協(xié)同化循證醫(yī)學(xué)服務(wù)團(tuán)隊(duì)
醫(yī)學(xué)情報(bào)服務(wù)機(jī)構(gòu)組建成協(xié)同化循證醫(yī)學(xué)服務(wù)團(tuán)隊(duì),完善相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)信息資源建設(shè)以后,利用資源、技術(shù)和人才優(yōu)勢(shì),積極開(kāi)展情報(bào)信息服務(wù),建立循證醫(yī)學(xué)情報(bào)信息匯集與分析平臺(tái)與機(jī)制,運(yùn)用信息推送技術(shù)為循證醫(yī)學(xué)科研提供定題服務(wù),共建共享信息資源,及時(shí)全面地傳遞、交流發(fā)展態(tài)勢(shì),為科研團(tuán)隊(duì)和科研人員提供一個(gè)共同交流、學(xué)習(xí)、合作和制定計(jì)劃的平臺(tái)。
3.2 為循證醫(yī)學(xué)科研團(tuán)隊(duì)提供個(gè)性化情報(bào)信息
情報(bào)服務(wù)人員通過(guò)與臨床醫(yī)生的溝通與交流,全面客觀地分析醫(yī)生的循證醫(yī)學(xué)信息需求,通過(guò)相關(guān)信息情報(bào)收集、挖掘、知識(shí)發(fā)現(xiàn)等技術(shù),對(duì)所收集情報(bào)信息資源進(jìn)行篩選、統(tǒng)計(jì)分析和系統(tǒng)評(píng)價(jià),為循證醫(yī)學(xué)科研團(tuán)隊(duì)提供必要的、個(gè)性化的情報(bào)信息。通過(guò)交流反饋,持續(xù)跟蹤醫(yī)生的信息需求,定期向醫(yī)生提供最新動(dòng)態(tài)的循證醫(yī)學(xué)實(shí)踐信息和醫(yī)學(xué)信息分析評(píng)價(jià)等,為循證醫(yī)學(xué)發(fā)展提供多方位的循證服務(wù)支撐。
3.3 為循證醫(yī)學(xué)科研工作者提供必要的知識(shí)服務(wù)
篇13
文章編號(hào):1672-5913 (2007) 22-0068-03
1課程體系與教學(xué)團(tuán)隊(duì)建設(shè)
根據(jù)福建農(nóng)林大學(xué)的學(xué)科設(shè)置特點(diǎn)及計(jì)算機(jī)基礎(chǔ)教學(xué)和課程體系改革的需要,我們組建了計(jì)算機(jī)基礎(chǔ)教學(xué)團(tuán)隊(duì),整合了計(jì)算機(jī)公共基礎(chǔ)教學(xué)和專業(yè)基礎(chǔ)教學(xué)隊(duì)伍,團(tuán)隊(duì)帶頭人是教育部農(nóng)林類計(jì)算機(jī)基礎(chǔ)課程教學(xué)指導(dǎo)分委員會(huì)成員,團(tuán)隊(duì)成員中既包括計(jì)算機(jī)專業(yè)的教授、博士,也包含具有生命科學(xué)、農(nóng)業(yè)、林業(yè)和管理學(xué)等教育背景(碩士)的主講教師,能夠很好地適合福建農(nóng)林大學(xué)的學(xué)科設(shè)置特點(diǎn),為在不同層次的計(jì)算機(jī)基礎(chǔ)教學(xué)中做到因?qū)I(yè)施教提供了保障。
課程體系中的課程包括計(jì)算機(jī)公共基礎(chǔ)課和計(jì)算機(jī)專業(yè)基礎(chǔ)課,其中公共基礎(chǔ)課依照教育部1997年制定的高等院校非計(jì)算機(jī)專業(yè)的計(jì)算機(jī)培訓(xùn)目標(biāo),是一個(gè)包含有三個(gè)不同層次教育的課程體系,即“計(jì)算機(jī)文化基礎(chǔ)”、“計(jì)算機(jī)技術(shù)基礎(chǔ)”和“計(jì)算機(jī)應(yīng)用基礎(chǔ)”。第一層次的計(jì)算機(jī)文化基礎(chǔ)包括計(jì)算機(jī)系統(tǒng)、多媒體技術(shù)基礎(chǔ)、程序數(shù)據(jù)的結(jié)構(gòu)、組織和管理、數(shù)據(jù)庫(kù)技術(shù)基礎(chǔ)、計(jì)算機(jī)網(wǎng)絡(luò)與應(yīng)用及信息系統(tǒng)安全等內(nèi)容,其特點(diǎn)是涉及的計(jì)算機(jī)知識(shí)面很廣。第二層次的計(jì)算機(jī)技術(shù)基礎(chǔ)課程主要由程序設(shè)計(jì)類課程組成,包括VB、VFP、C、DELPHI和Java程序設(shè)計(jì)等,其特點(diǎn)是需要有較好的計(jì)算機(jī)專業(yè)基礎(chǔ)知識(shí)。第三層次的計(jì)算機(jī)應(yīng)用基礎(chǔ)課程包括多媒體技術(shù)應(yīng)用基礎(chǔ)、網(wǎng)頁(yè)設(shè)計(jì)與制作基礎(chǔ)、網(wǎng)絡(luò)應(yīng)用基礎(chǔ)等等,其特點(diǎn)是既需要計(jì)算機(jī)專業(yè)某方面的基礎(chǔ),又需要有相應(yīng)的應(yīng)用領(lǐng)域的基礎(chǔ)。
專業(yè)基礎(chǔ)課主要是“程序設(shè)計(jì)基礎(chǔ)”和“數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)”。其中“程序設(shè)計(jì)基礎(chǔ)”和第二層次的計(jì)算機(jī)技術(shù)基礎(chǔ)課程相關(guān),而“數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)”在實(shí)現(xiàn)計(jì)算機(jī)專業(yè)的人才培養(yǎng)目標(biāo)上起到舉足輕重的作用。要求通過(guò)對(duì)數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)的系統(tǒng)學(xué)習(xí)與研究,理解并掌握設(shè)計(jì)和應(yīng)用數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)的主要方法,學(xué)會(huì)分析數(shù)據(jù)對(duì)象的特性,以便選擇適當(dāng)?shù)臄?shù)據(jù)結(jié)構(gòu)、存儲(chǔ)結(jié)構(gòu)及相應(yīng)的算法,并初步掌握抽象數(shù)據(jù)類型的設(shè)計(jì)及其相關(guān)算法的時(shí)間分析和空間分析技巧;學(xué)會(huì)運(yùn)用基本數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)進(jìn)行復(fù)雜程序設(shè)計(jì)的訓(xùn)練過(guò)程;通過(guò)實(shí)驗(yàn)體會(huì)計(jì)算機(jī)方法學(xué)的理論、抽象和設(shè)計(jì)這三個(gè)過(guò)程,提高利用計(jì)算機(jī)解決實(shí)際問(wèn)題的能力和創(chuàng)新能力。“數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)”的許多應(yīng)用都可以體現(xiàn)在第三層次的計(jì)算機(jī)應(yīng)用基礎(chǔ)課程中。
2課程建設(shè)
教學(xué)團(tuán)隊(duì)一直非常重視課程體系中各門課程的課程建設(shè)。曾先后主持編寫教材15部,其中《程序設(shè)計(jì)》是國(guó)家“十一五”規(guī)劃教材,《算法與數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)》和《算法與數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)習(xí)題精解和實(shí)驗(yàn)指導(dǎo)》是高等院校信息技術(shù)規(guī)劃教材,《數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)學(xué)習(xí)輔導(dǎo)》是高等院校信息技術(shù)課程輔導(dǎo)叢書,《Java程序設(shè)計(jì)》是普通高校計(jì)算機(jī)專業(yè)精品教材系列,《面向?qū)ο蟪绦蛟O(shè)計(jì)-Java》是21世紀(jì)高等學(xué)校信息類專業(yè)規(guī)劃教材,《Visual Basic 程序設(shè)計(jì)》是21世紀(jì)高等學(xué)校信息類專業(yè)規(guī)劃教材,《計(jì)算機(jī)多媒體技術(shù)應(yīng)用基礎(chǔ)》、《計(jì)算機(jī)網(wǎng)絡(luò)技術(shù)應(yīng)用基礎(chǔ)》和《計(jì)算機(jī)信息技術(shù)應(yīng)用基礎(chǔ)》是面向21世紀(jì)計(jì)算機(jī)基礎(chǔ)系列教材,《網(wǎng)頁(yè)設(shè)計(jì)與制作》是大學(xué)計(jì)算機(jī)基礎(chǔ)教育規(guī)劃教材,《面向21世紀(jì)計(jì)算機(jī)基礎(chǔ)系列教材》和《數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)習(xí)題解析與上機(jī)實(shí)驗(yàn)指導(dǎo)》是華東高校計(jì)算機(jī)基礎(chǔ)教育研究會(huì)推薦教材,《Delphi程序設(shè)計(jì)與應(yīng)用教程》和《Delphi程序設(shè)計(jì)學(xué)習(xí)與實(shí)驗(yàn)指導(dǎo)》是福建省高校計(jì)算機(jī)統(tǒng)編教材。
各門課程都建立了課程組,大部分課程都建立了比較完備的教育資源。其中素材類教育資源有試題庫(kù)、試卷素材、媒體素材、文獻(xiàn)素材、課件素材、案例素材和常見(jiàn)問(wèn)題素材等。根據(jù)網(wǎng)絡(luò)教學(xué)的需要,大部分課程已經(jīng)建立了一些網(wǎng)絡(luò)資源,如CAI課件、無(wú)紙化考試系統(tǒng)等,在更大范圍、更便捷地實(shí)現(xiàn)資源共享。目前,已經(jīng)分別為“大學(xué)信息技術(shù)基礎(chǔ)”、“VB程序設(shè)計(jì)”、“VFP程序設(shè)計(jì)”、“程序設(shè)計(jì)基礎(chǔ)”和“數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)”等課程建立了多媒體課件制作項(xiàng)目組。同時(shí)建設(shè)了課程網(wǎng)站,集成了教學(xué)大綱、實(shí)驗(yàn)大綱、電子教材、電子教案、多媒體課件、網(wǎng)絡(luò)學(xué)習(xí)答疑系統(tǒng)等與課程建設(shè)相關(guān)的教學(xué)資源。在課程組成員多年的努力下,課程建設(shè)取得了有效的成效,比如,“數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)”課程分別在1999年和2007年獲得福建省省屬高校優(yōu)秀課程和福建省精品課程的稱號(hào)。
3“1+X+Y”平臺(tái)建設(shè)與實(shí)踐教學(xué)
目前,我們正結(jié)合本校的學(xué)科和專業(yè)特點(diǎn)進(jìn)行“計(jì)算機(jī)基礎(chǔ)1+X+Y平臺(tái)構(gòu)建與實(shí)施”的教改項(xiàng)目的建設(shè)。其中“1”是大學(xué)計(jì)算機(jī)基礎(chǔ)課程,全校性公共必修課;“X”是適應(yīng)不同專業(yè)設(shè)計(jì)的一組限定選修課程,全校學(xué)生必須選修其中一門課程,如VB、VFP等;“Y”是學(xué)生任選的信息類課程,目前我們已經(jīng)開(kāi)設(shè)了“網(wǎng)頁(yè)設(shè)計(jì)與制作”、“多媒體技術(shù)應(yīng)用基礎(chǔ)”、“網(wǎng)絡(luò)應(yīng)用基礎(chǔ)”三門選修課,得到了廣大學(xué)生的青睞和好評(píng)。我們的目標(biāo)是融合計(jì)算機(jī)科學(xué)、農(nóng)學(xué)、生命科學(xué)等多個(gè)學(xué)科門類,構(gòu)建具有農(nóng)林院校特色的課程體系。目前我們已經(jīng)針對(duì)生物類專業(yè)的學(xué)生編寫了教材《計(jì)算機(jī)在生物科學(xué)研究中的應(yīng)用》,并開(kāi)設(shè)選修課。我們已經(jīng)著手準(zhǔn)備新增全校公共可選的3S技術(shù)、生物信息學(xué)、農(nóng)業(yè)信息學(xué)、地理信息系統(tǒng)等特色課程,同時(shí)還將針對(duì)全國(guó)高校中我校獨(dú)有的蜂學(xué)專業(yè)開(kāi)設(shè)相應(yīng)的計(jì)算機(jī)特色課程,以更好地為該專業(yè)培養(yǎng)高級(jí)信息化人才服務(wù)。
在教學(xué)的實(shí)施過(guò)程中,結(jié)合不同專業(yè)學(xué)生的不同專業(yè)背景,嘗試在有限的公共基礎(chǔ)課教學(xué)中有選擇地融入專業(yè)基礎(chǔ)的教學(xué)。在第一層次進(jìn)行介紹,在第二層次時(shí)要求理解原理,而在第三層次實(shí)現(xiàn)應(yīng)用。通過(guò)這種方式,可以有效地提高非計(jì)算機(jī)專業(yè)的學(xué)生在本學(xué)科領(lǐng)域使用計(jì)算機(jī)進(jìn)行數(shù)據(jù)獲取、處理等計(jì)算機(jī)應(yīng)用能力。
計(jì)算機(jī)基礎(chǔ)是一系列實(shí)踐性很強(qiáng)的課程,只有讓學(xué)生多動(dòng)手、多實(shí)踐,通過(guò)編寫調(diào)試大量的程序、進(jìn)行大量的實(shí)例操作,才能使學(xué)生理解軟件的思想方法、積累軟件操作的經(jīng)驗(yàn),體會(huì)成功的樂(lè)趣,從而激發(fā)學(xué)習(xí)興趣。我們的指導(dǎo)思想是:課堂精講,上機(jī)多練,課程設(shè)計(jì)綜合實(shí)訓(xùn)、創(chuàng)新性實(shí)驗(yàn)結(jié)合專業(yè)。
(1) 示范式教學(xué),精講多練
講課全部使用多媒體網(wǎng)絡(luò)機(jī)房,教師采用案例教學(xué)與項(xiàng)目教學(xué)相結(jié)合的方式,以案例提出問(wèn)題。教師示范解決方案為基本形式,教師精講,直觀教學(xué),充分利用計(jì)算機(jī)的交互性特點(diǎn),一些操作性的內(nèi)容通過(guò)上機(jī)實(shí)踐來(lái)掌握。教師變傳授為主為指導(dǎo)為主,積極倡導(dǎo)自主、合作、探究的學(xué)習(xí)方式。
(2) 提高上機(jī)實(shí)驗(yàn)效果
為了培養(yǎng)學(xué)生的動(dòng)手能力和實(shí)際計(jì)算機(jī)操作能力,本課程安排了較多上機(jī)時(shí)間。我們要求學(xué)生每次上機(jī)都有明確的目的,完成一定的任務(wù)。上機(jī)練習(xí)題目全部是實(shí)際應(yīng)用開(kāi)發(fā)題目,而不是簡(jiǎn)單的驗(yàn)證和重復(fù),從而啟發(fā)學(xué)生開(kāi)拓創(chuàng)新。我們組織編寫了計(jì)算機(jī)基礎(chǔ)課程系列教材,精心設(shè)計(jì)了一批實(shí)例,既覆蓋講課內(nèi)容,又有實(shí)際應(yīng)用價(jià)值,并且注意了綜合性和趣味性。通過(guò)上機(jī)練習(xí),既能讓學(xué)生掌握課堂知識(shí),又能充分調(diào)動(dòng)學(xué)生的學(xué)習(xí)積極性,促進(jìn)學(xué)生的積極思考,激發(fā)學(xué)生的潛能。
(3) 課程設(shè)計(jì)
通過(guò)課程設(shè)計(jì),要求學(xué)生在教師的指導(dǎo)下分組完成一個(gè)比較完整的應(yīng)用程序開(kāi)發(fā)任務(wù)。課程設(shè)計(jì)既可以做規(guī)定題目,也鼓勵(lì)學(xué)生根據(jù)社會(huì)需要自選課題。課程設(shè)計(jì)規(guī)定一定的難度和工作量,要求遵守一定的設(shè)計(jì)規(guī)范,培養(yǎng)良好的編程習(xí)慣,書寫正規(guī)的技術(shù)文檔。通過(guò)這樣的訓(xùn)練,使學(xué)生對(duì)程序設(shè)計(jì)開(kāi)發(fā)、工具軟件應(yīng)用有比較全面的認(rèn)識(shí),了解中小型應(yīng)用程序的開(kāi)發(fā)步驟,掌握可視化應(yīng)用程序開(kāi)發(fā)的基本方法,使學(xué)生經(jīng)過(guò)一次開(kāi)發(fā)應(yīng)用程序的實(shí)際訓(xùn)練,從而提高開(kāi)發(fā)能力、動(dòng)手能力,培養(yǎng)團(tuán)隊(duì)精神和嚴(yán)謹(jǐn)?shù)墓ぷ鲬B(tài)度。
(4) 創(chuàng)新性、開(kāi)發(fā)性實(shí)驗(yàn)
鼓勵(lì)學(xué)生根據(jù)專業(yè)特點(diǎn)結(jié)合專業(yè)學(xué)習(xí)與研究需要進(jìn)行創(chuàng)新性實(shí)驗(yàn)的設(shè)計(jì),對(duì)有此需求的學(xué)生,我們提供實(shí)驗(yàn)室并分配指導(dǎo)老師進(jìn)行全程支持。
4教改成果與師資培養(yǎng)
主要的教學(xué)教改成果有:
(1) 我校一直強(qiáng)化專業(yè)基礎(chǔ)課《數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)》的課程建設(shè),曾先后出版系列教材5部,并分別于1999年和2007年獲得福建省省屬高校優(yōu)秀課程和福建省精品課程的稱號(hào)。
(2) 2000年,高等學(xué)校高級(jí)語(yǔ)言程序設(shè)計(jì)教學(xué)改革與實(shí)踐獲得福建農(nóng)林大學(xué)教學(xué)成果二等獎(jiǎng)。
(3) 2000年,開(kāi)放式實(shí)驗(yàn)教學(xué)改革與實(shí)踐獲得福建農(nóng)林大學(xué)教學(xué)成果二等獎(jiǎng)。
(4) 2001年,面向21世紀(jì)計(jì)算機(jī)基礎(chǔ)課程教學(xué)內(nèi)容與課程體系改革的研究獲得福州大學(xué)優(yōu)秀教學(xué)成果一等獎(jiǎng)。
(5) 2004年,高質(zhì)量的第一層次大學(xué)計(jì)算機(jī)教學(xué)改革實(shí)踐獲得福建農(nóng)林大學(xué)教學(xué)成果二等獎(jiǎng)。
(6) 高校計(jì)算機(jī)系列課程無(wú)紙化考試系統(tǒng)的研制,先后完成新版一級(jí)、二級(jí)VB、二級(jí)VFP和二級(jí)C等考試系統(tǒng),并在全省計(jì)算機(jī)等級(jí)考試中使用。在此基礎(chǔ)上,我們研制了多門課程的模擬練習(xí)系統(tǒng)供學(xué)生課后練習(xí)使用,其中VB模擬練習(xí)系統(tǒng)通過(guò)清華大學(xué)出版社向全國(guó)發(fā)行了2萬(wàn)余套,收到了良好的輔助教學(xué)效果。
我校在師資培養(yǎng)方面所做的工作主要有以下幾點(diǎn):
(1) 提高學(xué)歷。鼓勵(lì)中青年教師報(bào)考各類研究生,提高學(xué)歷水平?,F(xiàn)有4名教師獲取博士學(xué)位,10名教師獲得碩士學(xué)位,4名碩士研究生在讀。
(2) 外出進(jìn)修。積極選派具有高級(jí)職稱教師作為國(guó)內(nèi)外訪問(wèn)學(xué)者到其他高校學(xué)習(xí)取經(jīng)。
(3) 內(nèi)部培養(yǎng)。對(duì)于青年教師,建立導(dǎo)師制,迅速提高青年教師的主講水平。
(4) 通過(guò)科研項(xiàng)目培養(yǎng)人才。
(5) 鼓勵(lì)和扶持青年教師參加國(guó)際會(huì)議。近年來(lái),已有6人次參加了澳大利亞、香港和臺(tái)灣等地舉辦的國(guó)際學(xué)術(shù)會(huì)議。
(6) 加強(qiáng)教學(xué)規(guī)范化,提高整體教學(xué)水平。加強(qiáng)了教學(xué)的規(guī)范化管理,建立完善了各項(xiàng)教學(xué)文件,教學(xué)大綱、實(shí)驗(yàn)大綱、教學(xué)日志、電子教案、實(shí)驗(yàn)指導(dǎo)書、綜合訓(xùn)練題庫(kù)、考試題庫(kù)等資料完整規(guī)范,堅(jiān)持集體備課制度,互相聽(tīng)課制度,實(shí)現(xiàn)資源共享,互相學(xué)習(xí),集思廣益,提高了整體教學(xué)水平。
以上措施通過(guò)幾年來(lái)的實(shí)施,效果顯著,培養(yǎng)出了一批基礎(chǔ)知識(shí)扎實(shí)、知識(shí)面寬、作風(fēng)嚴(yán)謹(jǐn)、工作態(tài)度認(rèn)真、講課好、能開(kāi)發(fā)、自學(xué)能力強(qiáng)、富有改革進(jìn)取精神的教師隊(duì)伍。同時(shí),我們還積極接受其他院校的進(jìn)修教師(如武夷學(xué)院等),在積極推廣教改成果的同時(shí)還能吸收其他兄弟院校的教改成果,從而更好地推進(jìn)本校計(jì)算機(jī)基礎(chǔ)教學(xué)的改革。
5結(jié)束語(yǔ)
盡管經(jīng)過(guò)多年的努力取得了一些成績(jī),但為了更好地滿足我校建設(shè)規(guī)劃的需要,我們?nèi)匀灰趲熧Y隊(duì)伍、課程體系、教學(xué)資源等方面做更進(jìn)一步的努力。
作者簡(jiǎn)介
寧正元,男,教授,碩士生導(dǎo)師,福建農(nóng)林大學(xué)計(jì)算機(jī)與信息學(xué)院院長(zhǎng),福建省計(jì)算機(jī)基礎(chǔ)教育研究會(huì)理事長(zhǎng),福建省計(jì)算機(jī)學(xué)會(huì)副理事長(zhǎng),教育部計(jì)算機(jī)基礎(chǔ)課程教學(xué)指導(dǎo)委員會(huì)農(nóng)林類計(jì)算機(jī)基礎(chǔ)課程教學(xué)指導(dǎo)分委員會(huì)委員。主要研究方向有軟件基礎(chǔ)理論、智能計(jì)算與多Agent系統(tǒng)、農(nóng)林計(jì)算機(jī)應(yīng)用、生物信息學(xué)等。出版教材二十多部,發(fā)表學(xué)術(shù)論文七十多篇(其中SCI,EI收錄多篇)。是福建省優(yōu)秀中青年骨干教師,福建省“百千萬(wàn)人才工程”人選,“數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)”省級(jí)精品課程負(fù)責(zé)人,“計(jì)算機(jī)基礎(chǔ)”校級(jí)精品課程負(fù)責(zé)人。